结论概述：员工一旦被审计查出涉及100万的问题，其后果主要取决于这100万的性质、来源以及员工的具体行为。可能面临的后果包括但不限于公司内部的纪律处分、民事赔偿以及刑事责任。以下是对这些可能后果的详细分析。
一、公司内部纪律处分
违规行为的认定：
- 如果审计发现员工存在违规行为，如贪污、挪用资金、虚报费用等，且涉及金额达到100万，这通常会被视为严重违反公司规章制度的行为。
纪律处分的种类：
- 根据公司规章制度，员工可能面临警告、记过、降职、撤职甚至开除等纪律处分。这些处分旨在维护公司的正常运营秩序和内部纪律。
二、民事赔偿
赔偿责任的认定：
- 如果员工的违规行为给公司造成了经济损失，如贪污导致公司资金流失、虚报费用导致公司额外支出等，员工可能需要承担民事赔偿责任。
赔偿金额的计算：
- 赔偿金额通常根据实际损失来确定，可能包括直接损失和间接损失。在涉及100万的情况下，如果这是员工违规行为导致的直接经济损失，员工可能需要全额赔偿。
- 计算公式：赔偿金额 = 实际损失金额（如100万） + 可能产生的间接损失（如利息、诉讼费用等，具体根据实际情况计算）。
三、刑事责任
刑事犯罪的认定：
- 如果员工的违规行为触犯了刑法，如贪污罪、挪用资金罪、职务侵占罪等，且涉及金额达到刑事立案标准（通常远低于100万），员工可能面临刑事指控。
刑事责任的种类：
- 根据犯罪情节的严重程度，员工可能面临有期徒刑、拘役、罚金等刑事处罚。在涉及金额巨大的情况下，如100万，员工可能面临较重的刑罚。
刑事诉讼程序：
- 一旦刑事指控成立，员工将经历刑事诉讼程序，包括侦查、审查起诉、审判等阶段。在这个过程中，员工有权委托律师进行辩护，以维护自己的合法权益。
四、其他可能后果
行业禁入：
- 在某些行业，如金融、会计等，如果员工因违规行为受到严重处罚，可能会被行业组织或监管机构列入黑名单，导致未来无法在该行业从事相关工作。
社会声誉损害：
- 违规行为一旦曝光，可能会对员工的社会声誉造成严重影响，影响其未来的职业发展和个人生活。
建议与行动：
- 如果您或您身边的人面临类似情况，建议立即咨询专业律师，以了解具体的法律后果和应对策略。
- 在处理此类问题时，应积极配合审计和调查工作，如实说明情况，避免逃避或隐瞒事实，以免加重法律后果。
- 同时，应尽快采取措施弥补损失，如退还非法所得、赔偿公司损失等，以减轻可能的法律责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。