挂靠公司收取道路运输车辆转籍证明费用是否违法，需分情况讨论：

1. 若挂靠合同中有明确约定：

   • 法律分析：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是双方意思表示一致的协议，具有法律约束力。如果挂靠合同中明确约定了挂靠公司可以收取道路运输车辆转籍证明费用，并且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这种收费行为就是合法的。
   • 建议：在此情况下，车主应仔细审查挂靠合同，确认合同中是否有相关约定，并按照合同约定履行义务。如果对合同条款有疑问或不满，可以与挂靠公司协商修改合同或寻求法律途径解决。

2. 若挂靠合同中没有明确约定：

   • 法律分析：在没有合同约定的情况下，挂靠公司擅自收取道路运输车辆转籍证明费用可能构成违法。因为这种行为可能违反了《中华人民共和国价格法》中关于价格行为的规定，即经营者不得利用优势地位，强制服务并收费，或者收取不合理费用。此外，如果这种行为损害了车主的合法权益，车主还可以依据《中华人民共和国消费者权益保护法》等相关法律法规进行维权。
   • 建议：车主可以首先与挂靠公司进行沟通，要求其说明收费的依据和合理性。如果沟通无果，车主可以向当地的市场监督管理部门或交通运输管理部门进行投诉，寻求行政部门的帮助。同时，车主也可以考虑通过法律途径解决纠纷，如提起民事诉讼等。

额外提醒：

• 在处理此类纠纷时，车主应保留好相关证据，如挂靠合同、收费凭证、沟通记录等，以便在需要时提供证明。
• 由于法律问题的复杂性和多样性，车主在遇到具体问题时最好咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。

总结：挂靠公司收取道路运输车辆转籍证明费用是否违法，取决于挂靠合同中是否有明确约定。如果有约定且合法合规，则收费行为合法；如果没有约定或约定违法，则收费行为可能违法。车主在遇到此类问题时，应仔细审查合同条款，保留好相关证据，并咨询专业律师的意见。