多机构入养老保险是否合法，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若“多机构”指同一劳动者在多个机构同时参保
   根据《社会保险法》及《城镇企业职工基本养老保险关系转移接续暂行办法》，同一劳动者在同一时间段内只能在一个统筹地区参加基本养老保险。若劳动者同时与多个机构建立劳动关系（如全职工作+兼职），需由其中一方按实际工资总额缴纳养老保险，另一方无需重复缴纳。若多个机构均为其缴纳，属于重复参保，社保部门会要求退还重复部分，且退休时仅能享受一份养老金待遇。

2. 若“多机构”指多个机构联合为劳动者参保
   若劳动者与多个机构存在劳动关系（如关联企业、集团内部调动），且各机构分别按其实际支付工资缴纳养老保险，需确保总缴费基数不超过当地社平工资的300%（即缴费基数上限）。例如，劳动者在A机构月薪1万，B机构月薪2万，若当地社平工资为1万，则总缴费基数应为3万（1万+2万），但若当地上限为2.5万，则超出部分不计入养老金计算。

3. 若“多机构”指非劳动关系下的参保（如灵活就业人员委托多个机构代缴）
   灵活就业人员可通过社保代理机构缴纳养老保险，但同一时间段内只能委托一个机构代缴。若同时委托多个机构，属于重复参保，社保部门会要求退还重复部分，且可能面临行政处罚（如罚款）。

建议：

• 若您是劳动者，需确认与各机构的劳动关系是否真实，避免重复参保导致权益受损；
  
• 若您是企业，需严格审核劳动者劳动关系，避免为非全日制员工重复缴纳社保；
  
• 若涉及跨地区参保，需关注各地社保政策差异，确保合规性。
  

如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。