教师病假三个月是否要被扣绩效，主要取决于学校的规章制度是否合法、合理以及执行过程中是否遵循了相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、扣除绩效合理的情形
依据合法规章制度：
- 学校必须拥有合法制定的绩效工资考核制度，且该制度应明确规定了教师休病假期间绩效工资的扣除方式和标准。
- 制度需经过民主程序制定，如教职工代表大会讨论，并向教师进行公示或告知。若制度合法且教师已知悉，那么按照制度扣除绩效工资是合理的。
符合公平原则：
- 绩效工资旨在激励教师积极工作，提高教学质量和工作效率。教师休病假期间，若其工作任务无法正常完成或需同事分担，适当扣除绩效工资以体现工作量差异是合理的。
考虑实际情况：
- 扣除的绩效工资应与教师的实际缺勤情况相匹配，避免过度扣除。例如，如果病假期间教师仍承担了部分教学或管理工作，那么扣除的绩效工资应相应减少。
二、扣除绩效不合理的情形
制度不合法或未公示：
- 若学校的绩效工资考核制度未经合法民主程序制定，或未向教师公示、告知，则该制度对教师不具有约束力。此时扣除教师病假期间的绩效工资即为不合理。
过度扣除或违反法律：
- 扣除绩效工资的比例过高，明显超出合理范围，影响教师基本生活。例如，如果病假期间教师的基本工资和绩效工资被全部扣除，这显然是不合理的。
- 扣除方式违反相关法律法规，如劳动法中关于工资支付的规定。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
未考虑特殊情况：
- 对于因重大疾病或不可抗拒原因休病假的教师，学校应给予人文关怀，而非机械地按照制度扣除绩效工资。例如，如果教师因患癌症等重大疾病需要长期治疗，学校应考虑其实际情况，适当减少或免除绩效工资的扣除。
三、法律途径与维权建议
沟通协商：
- 教师首先应与学校进行沟通协商，要求学校说明扣除的依据和理由。如果学校能够提供合理的解释和依据，教师可以考虑接受；如果学校无法提供合理的解释或依据，教师可以进一步采取其他措施。
行政投诉：
- 若协商不成，教师可向当地教育行政部门反映情况，寻求帮助和解决。教育行政部门有责任对学校的规章制度进行监督和检查，确保其合法、合理。
劳动仲裁或诉讼：
- 在必要时，教师可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，教师应保留相关证据，如病假证明、工资单、规章制度等，以便在仲裁或诉讼中提供有力支持。
总结来说，教师病假三个月是否要被扣绩效并没有一个固定的答案，而是需要根据学校的规章制度、病假时长和原因以及相关法律法规进行综合判断。如果教师认为学校的扣除行为不合理或违法，可以通过沟通协商、行政投诉或劳动仲裁等途径来维护自己的权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。