商家拒绝合并开具发票是违法的。以下是对此问题的详细分析：
法律依据
《中华人民共和国发票管理办法》第十九条：明确规定销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项时，收款方必须向付款方开具发票。这意味着，商家在收到消费者款项后，有义务为消费者开具发票，无论发票是单独开具还是合并开具，只要消费者有要求，商家就应当满足。
《中华人民共和国消费者权益保护法》第二十二条：强调经营者提供商品或服务时，应按照国家有关规定或商业惯例向消费者出具发票等购货凭证或服务单据。消费者索要发票时，经营者必须出具。这一条款进一步明确了商家在消费者索要发票时的法定义务。
商家拒绝合并开票的可能原因及法律解读
推诿或拒绝理由：
- 商家可能会以“发票用完了”、“财务不在”、“系统故障”等理由推诿或拒绝合并开具发票。
- 法律解读：这些理由均不构成合法抗辩。商家有义务确保发票的充足供应，并在消费者索要时及时开具。若商家确实因特殊原因无法立即开具，应与消费者协商确定开具时间，并出具书面承诺或收据。
要求额外支付费用：
- 商家可能会要求消费者额外支付税点或手续费才同意合并开具发票。
- 法律解读：开具发票是商家的法定义务，价格已包含税款，额外要求支付税点或手续费是不合理且违法的。消费者有权拒绝这一要求，并坚持按实际消费金额开具发票。
消费者应对策略及维权途径
与商家协商：
- 消费者可以首先尝试与商家沟通，说明法律规定和自身权益，要求商家依法开具发票。
- 若商家同意开具，但提出不合理条件（如额外支付费用），消费者应明确拒绝，并坚持按实际消费金额开具。
向税务机关投诉：
- 若商家拒绝开具发票或提出不合理条件，消费者可以向当地税务机关投诉。
- 投诉时，消费者应提供详细信息及消费凭证，如小票、支付记录等，以便税务机关调查处理。
- 税务机关将依法对违法商家进行处罚，并责令其开具发票。
法律诉讼：
- 在涉及金额较大且税务机关处理后问题仍未解决的情况下，消费者可以考虑通过法律诉讼维护自身权益。
- 诉讼前，消费者应咨询专业律师（即我，孙逊律师，专注于经济纠纷、合同纠纷领域），了解诉讼流程和可能的风险。
注意事项
- 保留证据：无论采取何种维权途径，消费者都应妥善保存购物凭证、收据、聊天记录等证据，以备不时之需。
- 增强法律意识：消费者应了解相关法律法规，明确自身权益和商家的法定义务，以便在维权过程中有理有据。
- 及时维权：发现商家拒开发票行为后，消费者应及时采取措施维权，避免拖延导致权益受损。
综上所述，商家拒绝合并开具发票是违法的，消费者有权要求商家依法开具发票，并可通过多种途径维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。