房屋因抵押不能过户，双方可以签订协议，但该协议的效力及能否实现过户目的需分情况讨论，具体如下：

1. 协议本身的效力
   根据《民法典》第143条，只要双方具备完全民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或公序良俗，协议即有效。因此，即使房屋因抵押无法立即过户，双方签订的关于房屋买卖、权利义务分配的协议本身是有效的。例如，协议可约定买方支付部分房款，卖方在解除抵押后配合过户，此类条款受法律保护。

2. 协议能否直接导致过户

   • 抵押未解除前，无法完成过户：根据《民法典》第406条，抵押期间抵押人可以转让抵押财产，但需及时通知抵押权人，且转让价款需优先清偿债务或提存。若抵押权人不同意转让（如合同另有约定），或卖方未清偿债务，房屋仍存在权利负担，房管部门通常不会办理过户。
     
   • 协议可约定违约责任：若因卖方原因（如未解除抵押）导致无法过户，买方可依据协议要求卖方承担违约责任（如赔偿损失、支付违约金等），但无法直接强制过户。

3. 实务建议

   • 明确抵押解除条款：在协议中约定卖方解除抵押的具体时间、方式（如用买方首付款清偿债务），并设置违约条款保障买方权益。
     
   • 资金监管或提存：为避免卖方挪用房款，可约定将部分房款存入第三方监管账户，待抵押解除后直接支付给抵押权人。
     
   • 要求卖方提供担保：若抵押金额较大，可要求卖方提供其他资产作为履约担保，降低买方风险。
     
   • 及时办理预告登记：根据《民法典》第221条，买方可与卖方申请预告登记，防止卖方“一房二卖”，但预告登记本身不解除抵押，仍需卖方配合完成本登记。

总结：协议有效，但需通过约定解除抵押、设置违约责任等方式保障履行；若抵押未解除，直接过户存在法律障碍。建议根据具体情况设计协议条款，必要时委托律师起草或审核合同。如有进一步疑问，可直接向我咨询。