针对采购合同中部分发票未开具的情况，可按以下步骤处理：

1. 核查合同条款与交易记录
   首先需确认合同中是否明确约定了发票开具的时间、方式及违约责任条款。例如，合同可能规定“卖方应在收到货款后15个工作日内开具全额增值税专用发票”，或约定“分期付款对应分期开票”。若合同无明确约定，则需结合《民法典》中关于合同履行的一般规定及交易习惯处理。
   同时，需整理交易过程中的付款凭证、送货单、对账单等证据，确认未开票部分对应的货物或服务是否已实际交付、金额是否准确，避免因金额争议导致开票纠纷。

2. 与对方协商补开发票
   若未开票是由于对方疏忽或流程延误，可优先通过书面函件（如律师函、企业公函）或邮件形式催告对方补开，并明确补开期限（如“请于收到本函后5个工作日内开具金额为XX元的发票并寄送至我司”）。协商时需注意保留沟通记录，以备后续维权使用。
   提示：若对方以“未收到货款”“合同未履行完毕”等理由拒绝开票，需结合合同约定及实际履行情况反驳。例如，若合同约定“先票后款”但实际已部分付款，可主张对方已通过行为变更合同履行方式。

3. 通过法律途径主张权利
   若协商无果，可依据《民法典》第577条“当事人一方不履行合同义务或履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任”起诉对方，要求：

   • 补开发票（若对方仍具备开票能力）；
     
   • 赔偿因未开票导致的损失（如无法抵扣进项税的税款损失、行政处罚风险等）。
     注意：若对方已注销或丧失开票资格，可主张将未开票金额从应付货款中扣除，或要求对方以现金方式补偿税款损失。

4. 税务合规与风险防范
   从税务角度，买方需确保未开票部分未被计入成本费用，否则可能面临税务机关调整应纳税所得额、加收滞纳金甚至罚款的风险。建议：

   • 暂缓支付未开票部分对应的货款，直至对方开票；
     
   • 若已支付，需在企业所得税汇算清缴时调增应纳税所得额，并留存合同、付款凭证等证据备查。
     

行动建议：

• 立即向对方发送书面催告函，明确补开要求及法律后果；
  
• 同步整理交易证据，评估诉讼可行性及损失金额；
  
• 咨询税务专业人士，确保企业税务处理合规。
  

如有进一步细节（如合同条款、对方拒绝理由等），可提供具体信息以便针对性分析。