结论：员工往公司账户打钱用于运营公司，在公司倒闭的情况下能否追回款项，需分情况讨论，主要取决于款项性质、公司性质以及相关法律程序等因素。以下为具体分析：

1. 款项性质为借款
   • 如果员工打入公司账户的钱明确为借款性质，即双方有书面或口头的借款协议，约定了借款金额、还款期限、利息等相关条款。在这种情况下，员工与公司之间形成了借贷法律关系。
   • 当公司倒闭时，员工作为债权人，有权依据借款协议向公司主张债权。在公司破产清算程序中，员工的借款债权属于普通债权，将按照法定顺序参与公司财产的分配。不过，普通债权在分配顺序上相对靠后，只有在清偿完破产费用、共益债务以及职工工资、社会保险费用和法定补偿金、税款等优先债权后，若有剩余财产，才会按照比例分配给普通债权人。所以，员工有可能追回部分或全部借款，但具体金额取决于公司剩余财产的多少。
2. 款项性质为投资款
   • 若为公司增资：如果员工打入的钱是用于增加公司的注册资本，即通过增资扩股的方式成为公司股东。那么在公司倒闭进行清算时，员工作为股东，其权益将按照股东的出资比例在公司剩余财产中分配。但同样，股东的分配顺序在债权人之后，只有在清偿完所有债务后，若有剩余财产，股东才能获得分配。而且，如果公司在经营过程中存在亏损，员工的投资款可能会因公司资产不足以清偿债务而无法全额追回，甚至可能血本无归。
   • 若为股权投资（非增资）：员工通过购买公司原有股东的股权成为公司股东，这种情况下，员工与公司之间并不直接产生资金往来关系，而是与出让股权的股东之间存在股权转让关系。当公司倒闭时，员工作为股东的权益处理方式与上述增资情况类似。但如果股权转让协议中存在特殊约定，例如出让股东对公司债务承担连带责任等，员工可以根据协议约定向出让股东主张权利。
3. 款项性质不明或无合法依据
   • 如果员工打入公司账户的钱没有明确的性质约定，既不是借款也不是投资款，且无法提供合理的打款依据和说明。在这种情况下，员工主张追回款项可能会面临较大的困难。公司可能会以各种理由拒绝返还，而员工需要承担举证责任，证明该款项的合法性和应返还性。如果无法提供充分证据，员工的诉求可能得不到法律支持。

建议：

• 员工应尽快收集与打款相关的证据，如转账凭证、借款协议、投资协议、沟通记录等，以明确款项的性质和用途。
• 及时关注公司的破产清算进展，按照法定程序申报债权。如果对公司破产清算程序不了解，可以寻求专业法律帮助，确保自己的权益得到最大程度的维护。
• 在今后的经济活动中，对于涉及大额资金往来，尤其是与公司之间的资金往来，应签订详细的书面协议，明确双方的权利义务，避免产生不必要的纠纷。

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