综合工时制下，用人单位是可以安排员工连续夜班的，但需要满足一定的条件并遵循相关法律规定。以下从多个角度为你详细分析：
一、综合工时制的定义与特点
综合工时制，是指用人单位因生产特点不能实行标准工时制，经劳动行政部门批准，对特定岗位的员工实行以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间的一种工时制度。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但平均日和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
二、连续夜班安排的合法性
法律允许性：
- 综合工时制本身并不禁止用人单位安排员工连续夜班。只要用人单位依法申请并获得了劳动行政部门的批准，且综合计算周期内的总工作时间未超过法定标准，那么安排连续夜班在法律上是可行的。
员工健康与休息权保障：
- 尽管法律允许安排连续夜班，但用人单位必须确保员工的身体健康和休息权不受侵害。这包括提供必要的休息设施、合理安排夜班后的补休或支付加班费等。
- 根据《劳动法》的相关规定，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。在综合工时制下，这一原则同样适用，只是具体休息日的安排可能因生产特点而有所调整。
加班费支付：
- 如果员工在综合工时制下的实际工作时间超过了法定标准工作时间，用人单位应当按照法律规定支付加班费。对于夜班工作，如果符合加班的条件（如超出综合计算周期内的平均工作时间），用人单位也应支付相应的加班费。
三、实际操作中的注意事项
依法申请综合工时制：
- 用人单位在实施综合工时制前，必须依法向劳动行政部门提出申请，并获得批准。未经批准擅自实施综合工时制的，将面临法律责任。
明确告知员工：
- 用人单位在实施综合工时制时，应当明确告知员工相关的工作时间安排、加班费支付标准等事项，确保员工的知情权得到保障。
合理安排工作时间与休息：
- 用人单位在安排连续夜班时，应充分考虑员工的身体承受能力和休息需求，合理安排工作时间和休息时间，避免过度劳累和健康损害。
四、法律后果与风险防范
法律后果：
- 如果用人单位违反法律规定安排连续夜班或未支付加班费等，员工有权向劳动行政部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位承担相应的法律责任。
风险防范：
- 用人单位应建立健全的工时管理制度和加班费支付制度，确保综合工时制的实施符合法律规定。同时，加强与员工的沟通与协商，共同维护和谐的劳动关系。
总结来说，综合工时制下用人单位可以安排员工连续夜班，但必须依法申请并获得批准，同时确保员工的身体健康和休息权不受侵害，并按照法律规定支付加班费。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。