结论：农村基本农田被占了二十年，能否要回来需视具体情况而定，包括占用行为的性质、是否经过合法审批、是否超过诉讼时效等因素。以下从不同角度为您详细分析：
一、占用行为的性质与合法性
非法占用：
- 如果占用行为未经合法审批，属于非法占用，您有权要求返还土地。根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，非法占用土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
合法占用但超期或改变用途：
- 如果占用行为最初经过合法审批，但占用期限已满或改变了土地用途（如将农田改为建设用地），您同样有权要求返还土地或恢复土地原状。
二、诉讼时效问题
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。然而，在土地纠纷中，由于涉及土地权属的确认和保护，诉讼时效的适用可能更为复杂。
特殊情形下的诉讼时效：
- 如果占用行为持续存在，且您一直对此提出异议或主张权利，诉讼时效可能并未开始计算或已中断。此外，如果占用行为涉及违法犯罪（如非法转让、倒卖土地使用权罪），则不受诉讼时效的限制。
三、实际操作建议
收集证据：
- 首先，您需要收集能够证明土地权属、占用行为以及占用时间的证据，如土地承包合同、土地使用证、现场照片、证人证言等。
协商与调解：
- 在提起诉讼前，您可以尝试与占用方进行协商或寻求第三方调解，以和平解决纠纷。
提起诉讼：
- 如果协商和调解无果，您可以向人民法院提起诉讼，要求返还土地、恢复原状或赔偿损失。在诉讼过程中，您需要充分举证，证明自己的主张。
四、注意事项
- 法律程序：在处理土地纠纷时，务必遵循法律程序，不要采取过激行为或私力救济方式。
- 专业咨询：由于土地纠纷涉及复杂的法律问题和地方政策，建议您在处理过程中咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保护。
进一步思考：在处理此类纠纷时，除了考虑法律因素外，还需要考虑实际执行的可能性以及双方的关系和利益平衡。如果占用方已经对土地进行了大量投资或建设，返还土地可能会对其造成较大损失。在这种情况下，您可以考虑通过协商或调解方式寻求双方都能接受的解决方案，如土地置换、补偿等。
最后，如果您在处理此类纠纷过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。