若分居租房时另一方不签协议，可先尝试沟通协商，若协商不成，可通过收集证据来保障自身权益。以下从不同角度为你详细分析：
沟通协商层面
- 尝试友好沟通：首先，建议与另一方进行坦诚、友好的沟通。明确表达签订分居租房协议的目的和重要性，比如协议可以明确双方在分居期间的权利和义务，包括房租的承担、房屋的使用规则、物品的归属等，避免日后产生不必要的纠纷。在沟通时，要注意语气平和，尊重对方的意见和感受，尽量寻求双方都能接受的解决方案。
- 借助第三方调解：如果直接沟通无法达成一致，可以考虑邀请双方都信任的第三方进行调解，如共同的朋友、亲戚或专业的调解机构。第三方可以从客观、中立的角度出发，帮助双方分析问题，提出合理的建议，促使双方签订协议。
证据收集层面
如果经过沟通协商，另一方仍然拒绝签订协议，那么你需要收集相关证据来证明分居租房的事实以及双方关于租房的相关约定，以保障自己的合法权益。
- 收集书面证据：
- 聊天记录：保存与另一方关于分居租房的聊天记录，包括微信、短信、邮件等。这些聊天记录可以证明双方就分居租房进行了沟通，以及双方的一些约定和想法。
- 书面沟通文件：如果双方有过书面的沟通文件，如信件、便签等，也要妥善保存。这些文件可以作为证明双方关系的辅助证据。
- 收集证人证言：如果有了解双方分居租房情况的证人，如邻居、房东等，可以请他们出具证人证言。证人证言可以证明双方分居租房的事实以及双方在租房过程中的一些行为和情况。
- 收集其他证据：
- 租房合同：如果房屋是以一方名义租赁的，要保存好租房合同，以证明租房的事实和租房的相关条款。
- 付款凭证：保存好自己支付房租、水电费等费用的凭证，如银行转账记录、收据等。这些凭证可以证明自己在租房过程中的实际支出。
法律途径层面
如果另一方的行为严重损害了你的合法权益，且通过上述方法无法解决问题，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
- 起诉要求确认相关事实：你可以向法院提起诉讼，要求法院确认双方分居租房的事实以及双方在分居期间的一些约定。在诉讼过程中，你需要提供上述收集到的证据来支持自己的主张。如果法院确认了相关事实，这将为你在后续的权益维护中提供有力的法律依据。
- 主张损害赔偿：如果另一方的行为给你造成了经济损失，如你支付了本应由另一方承担的房租等，你可以在诉讼中主张要求另一方进行损害赔偿。法院会根据具体情况判决另一方承担相应的赔偿责任。