员工集体对抗公司并选择离职这一行为，从法律层面讲，集体辞职本身并不违法，但必须确保符合法律规定和劳动合同的约定。以下是对此问题的详细分析：
一、合法性分析
法定解除情形：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，若公司存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，员工有权解除劳动合同，包括集体辞职。这是员工依法维护自身合法权益的行为。
- 同时，若公司以暴力、威胁或非法限制人身自由的手段强迫员工劳动，或违章指挥、强令冒险作业危及员工人身安全，员工可以立即解除劳动合同，无需事先告知。
协商一致：
- 依据《劳动合同法》第三十六条，如果员工集体与公司就辞职事宜进行协商并达成一致意见，且办理了相关离职手续，这种集体辞职行为是合法的。
提前通知：
- 根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同（试用期内提前三日通知）。这一条款同样适用于集体辞职的情况，只要员工遵循了提前通知的程序，其辞职行为就是合法的。
二、法律风险与注意事项
违反劳动合同约定：
- 如果员工与公司签订了劳动合同，并明确约定了服务期限、竞业限制等条款，而员工集体违反这些约定辞职，可能构成违约，需要承担相应的违约责任。例如，违反服务期约定的员工可能需要向公司支付违约金。
给公司造成损失：
- 员工集体辞职若导致公司的生产经营受到严重影响或无法正常运转，公司可能会要求员工赔偿因此造成的损失。根据《劳动合同法》第九十条，劳动者违反本法规定解除劳动合同，或违反劳动合同中约定的保密义务或竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
遵循法定程序：
- 在集体辞职的过程中，员工应确保遵循所有法定的辞职程序，如提前通知、办理离职手续等，以避免因程序不当而引发的法律纠纷。
恶意串通与不正当竞争：
- 若员工通过集体辞职胁迫公司提高待遇，或故意制造经营困难以谋取不当利益，可能涉嫌不正当竞争甚至刑事犯罪。
三、企业应对措施建议
完善制度预防风险：
- 公司应在劳动合同中明确约定竞业限制、服务期等条款，并建立人才储备机制以降低关键岗位离职冲击。
强化证据意识：
- 公司应保存考勤记录、工作交接凭证等证据材料，为可能的劳动争议做好应诉准备。
及时法律救济：
- 若发现员工存在违法行为，公司可通过劳动仲裁主张违约金赔偿，必要时采取诉讼手段维护权益。
四、总结与建议
员工集体辞职并不违法，但必须确保符合法律规定和劳动合同的约定。在辞职前，员工应与公司进行充分沟通，尽量通过协商一致的方式解决辞职问题。同时，员工也应确保自己的辞职行为不会给公司造成不必要的损失或违反合同义务。如果辞职过程中遇到任何法律问题或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和指导。对于公司而言，应完善相关制度、强化证据意识，并在必要时及时寻求法律救济。