关于单位扣独生子女费是否合理的问题，这主要取决于具体的政策规定以及单位与员工之间的约定。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，独生子女费通常是由政府为了鼓励计划生育、奖励独生子女家庭而设立的一种补贴或奖励。这种费用的发放标准和方式，往往因地区和政策的不同而有所差异。
一、政策层面
国家政策：从国家层面来看，对于独生子女家庭的奖励和优待政策是明确的。例如，已经领取《独生子女父母光荣证》的夫妻，在符合一定条件下，可以享受每月的独生子女父母奖励费，以及退休后的相关补贴等。这些政策旨在保障独生子女家庭的权益，提高他们的生活水平。
地方政策：各地政府也根据自身的实际情况，出台了相应的独生子女家庭奖励政策。这些政策可能包括奖励费的发放标准、发放方式、发放期限等。例如，北京、江西、深圳等地都有明确的独生子女父母奖励政策，且奖励标准各不相同。
二、单位层面
单位规定：单位是否有权扣除独生子女费，首先取决于单位自身的规定。如果单位在员工入职时或后续通过规章制度明确规定了独生子女费的发放和扣除方式，且这些规定不违反国家法律法规和地方政策，那么单位在符合规定的情况下扣除独生子女费可能是合理的。
员工权益：然而，如果单位没有明确的规章制度，或者规章制度中的相关规定违反了国家法律法规和地方政策，那么单位扣除独生子女费就可能是不合理的。在这种情况下，员工有权向单位提出异议，并要求单位按照政策规定发放独生子女费。
三、建议
了解政策：首先，建议您了解所在地区和单位关于独生子女费的具体政策规定。这可以通过查阅相关政策文件、咨询当地计划生育部门或单位人事部门等方式实现。
与单位沟通：如果您对单位扣除独生子女费的做法有疑问或不满，建议您与单位进行沟通。在沟通过程中，您可以明确表达自己的诉求和依据，要求单位给出合理的解释和解决方案。
寻求法律援助：如果沟通无果，且您认为单位的做法确实违反了相关法律法规和政策规定，那么您可以考虑寻求法律援助或向相关部门投诉举报。
综上所述，单位扣独生子女费是否合理取决于具体的政策规定和单位与员工之间的约定。在了解政策、与单位沟通并寻求法律援助的基础上，您可以更好地维护自己的合法权益。