结论：员工在工厂不巡检是否能被合法辞退，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从规章制度的角度
若工厂有明确规定巡检为员工职责，且员工无正当理由拒绝：
- 根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。在此情况下，如果工厂的规章制度中明确规定了巡检是员工的职责，并且员工无正当理由拒绝执行，那么工厂有权依据规章制度辞退该员工，且这种辞退行为是合法的。
- 举例：某工厂的《员工手册》中明确规定，生产线员工需每日定时进行设备巡检，以确保生产安全。若某员工连续多日拒绝巡检，且无正当理由，工厂依据《员工手册》的规定将其辞退，这一行为是合法的。
若工厂规章制度未明确规定巡检职责，或规定不明确：
- 如果工厂的规章制度中没有明确规定巡检是员工的职责，或者规定不够明确，导致员工对是否需要巡检存在疑问，那么工厂不能仅凭员工不巡检就将其辞退。在此情况下，工厂应先完善规章制度，明确巡检职责，并通过培训等方式确保员工了解并遵守。
二、从劳动合同的角度
若劳动合同中明确约定了巡检职责：
- 如果劳动合同中明确约定了员工需要承担巡检的职责，那么员工拒绝巡检就构成了违反劳动合同的行为。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位在员工严重违反劳动合同的情况下，有权解除劳动合同。
若劳动合同中未约定巡检职责：
- 如果劳动合同中没有明确约定巡检是员工的职责，那么工厂就不能仅凭员工不巡检就主张其违反劳动合同。在此情况下，工厂应与员工协商，通过补充协议或修改劳动合同的方式明确巡检职责。
三、从实际工作需要的角度
- 即使规章制度或劳动合同中没有明确规定巡检职责，但如果巡检是实际工作所必需的，且员工明知这一点却拒绝执行，那么工厂也可以考虑根据实际情况对员工进行处理。不过，在这种情况下，工厂应先与员工沟通，了解其拒绝巡检的原因，并尝试通过协商解决问题。如果协商无果，且员工的行为确实严重影响了工厂的正常运营或生产安全，工厂可以考虑依据相关法律法规和规章制度对员工进行处理，但应确保处理程序的合法性和公正性。
建议：
- 对于工厂而言，应完善规章制度和劳动合同，明确巡检等职责，并通过培训等方式确保员工了解并遵守。
- 对于员工而言，应认真履行自己的职责，包括巡检等任务。如果对职责有疑问或认为不合理，应及时与工厂沟通并寻求解决方案。
后续行动：如果您或您的工厂遇到类似问题，建议先审查规章制度和劳动合同，了解巡检职责的明确性。如有需要，可以进一步向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。