结论：甲方要求乙方退回因开具免税发票而节省的税款，这一行为是否合法，需根据具体情况来判断，一般情况下不合法，但若双方有明确约定且该约定不违反法律法规强制性规定，则可能合法。
分析说明：
一般情况下的不合法性：
- 在建设工程合同中，乙方作为施工方，按照税法规定应缴纳相应的税款。若乙方因符合免税条件而开具了免税发票，这是乙方依法享受的税收优惠政策，节省的税款应归乙方所有。
- 甲方作为合同的一方，无权要求乙方退回因享受税收优惠政策而节省的税款。这种要求可能违反了税法的相关规定，也损害了乙方的合法权益。
双方有明确约定且合法的情况：
- 如果双方在合同中明确约定了，在乙方开具免税发票的情况下，甲方有权要求乙方退回节省的税款，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种要求可能是合法的。
- 但需要注意的是，这种约定必须是在双方平等自愿、协商一致的基础上达成的，且不得损害国家、集体或第三人的利益。
法律建议：
对于乙方：
- 在签订合同时，应仔细审查合同条款，特别是关于税款承担和发票开具的条款，确保自己的权益不受损害。
- 如果甲方提出退回税款的要求，乙方应首先审查合同条款，如果合同中没有相关约定或约定不明确，乙方有权拒绝甲方的要求。
- 如果甲方坚持要求退回税款，乙方可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
对于甲方：
- 在提出退回税款的要求前，应仔细审查合同条款，确保自己的要求有合同依据。
- 如果合同中没有相关约定或约定不明确，甲方应认识到自己的要求可能缺乏法律依据，并考虑与乙方协商解决或放弃该要求。
- 如果甲方坚持要求退回税款且乙方拒绝，甲方应谨慎行事，避免采取违法手段强行要求乙方退回税款，以免引发法律纠纷。
后续行动：
- 如果双方无法就退回税款的问题达成一致意见，可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等法律途径解决纠纷。
- 在处理此类纠纷时，建议双方都咨询专业律师的意见，以便更好地了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。
可能法律后果：
- 如果甲方强行要求乙方退回税款且乙方拒绝，甲方可能面临无法实现其要求的风险，并可能因采取违法手段而承担法律责任。
- 如果乙方在未经甲方同意的情况下擅自使用免税发票并拒绝退回节省的税款，且合同中有相关约定，乙方可能面临违约责任的风险。