解除劳动合同证明的三联通常分别由员工本人、用人单位留存以及放入员工个人档案，其中放入员工个人档案的通常是用人单位留存联或专门用于存档的联次，具体以单位规定和实际操作流程为准，但核心原则是确保员工档案中有完整记录且用人单位和员工各持一份。以下是对此问题的详细解释：

一、解除劳动合同证明的三联分配

1. 员工本人联：这一联是给员工本人的，作为其与用人单位解除劳动合同的直接证据。员工应妥善保管此联，以备未来可能需要的证明或查询。

2. 用人单位留存联：这一联由用人单位保留，作为其与员工解除劳动合同的官方记录。用人单位应按照档案管理规定，将此联妥善保存，以备未来审计、查询或法律纠纷时使用。

3. 存档联：这一联通常用于放入员工的个人档案中。个人档案是员工职业生涯的重要记录，包括其工作经历、培训记录、奖惩情况等。解除劳动合同证明作为员工工作经历的一部分，应被纳入个人档案中，以便未来查询或证明。在实际操作中，存档联可能是用人单位留存联的副本，也可能是专门为存档而设计的联次，具体取决于用人单位的规定和实际操作流程。

二、放入档案的具体联次

• 通常做法：在大多数情况下，用人单位会将其留存联或专门设计的存档联放入员工个人档案中。这样做既符合档案管理的要求，也便于未来查询和证明。

• 单位规定：不同用人单位可能有不同的规定和实际操作流程。有些单位可能要求员工本人将解除劳动合同证明交给档案管理部门，由档案管理部门负责存档；而有些单位则可能直接由人力资源部门或相关部门负责存档。因此，具体放入哪一联以及如何存档，应遵循用人单位的规定和实际操作流程。

三、法律建议

1. 了解单位规定：作为员工，应了解所在用人单位关于解除劳动合同证明存档的具体规定和流程，以便按照要求办理相关手续。

2. 妥善保管个人联：员工应妥善保管自己手中的解除劳动合同证明联次，以备未来可能需要的证明或查询。

3. 咨询相关部门：如果对解除劳动合同证明的存档有任何疑问或不确定的地方，可以及时向用人单位的人力资源部门或档案管理部门咨询，以确保手续的正确办理。

如果您在解除劳动合同或相关证明存档方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。