关于您提出的“劳动合同写辞职提前两个月申请是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据与常规做法
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条的规定，劳动者在解除劳动合同时，通常只需提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期则需提前三日）。这是法律规定的最低预告期限，旨在保障用人单位有足够的时间进行工作交接和人员调整。因此，从常规做法来看，劳动合同中约定提前两个月申请辞职并非法律所要求的。
二、特别约定的合法性
然而，法律也允许劳动者和用人单位在劳动合同中作出特别约定，只要这些约定不违反法律法规的强制性规定。如果您的劳动合同中明确写明了辞职需提前两个月申请，并且这一约定是双方自愿、平等协商的结果，那么该约定在法律上是有效的，您应当遵守。但值得注意的是，这种特别约定应当合理，不应过分加重劳动者的负担或剥夺其合法权益。
三、特殊情况下的处理
用人单位存在过错：如果用人单位存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等法定过错情形，您有权立即解除劳动合同，无需提前通知，更无需遵守提前两个月的约定。
协商一致解除：如果您与用人单位协商一致，同意提前两个月离职，并且这一决定是双方自愿、平等协商的结果，那么这种情况是合法有效的。
四、建议与措施
审查劳动合同：首先，请仔细审查您的劳动合同，确认其中关于辞职提前通知期限的约定是否合法、合理。
与用人单位沟通：如果您认为提前两个月的约定不合理或存在特殊情况需要提前离职，建议与用人单位进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。
保留证据：无论您最终决定如何，都请保留好相关证据，如辞职申请、沟通记录等，以备不时之需。
寻求法律帮助：如果用人单位拒绝协商或存在违法行为，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向劳动监察部门投诉，以维护自己的合法权益。
综上所述，劳动合同中约定辞职提前两个月申请是否合法，需根据具体情况判断。如果这一约定是双方自愿、平等协商的结果，并且不违反法律法规的强制性规定，那么它是有效的；否则，您有权拒绝遵守并寻求法律帮助。希望这些解答能对您有所帮助。