公司要证明没有某个员工，可以从以下几个方面入手收集证据，以形成完整的证据链：
一、劳动关系层面
劳动合同检查：
- 未签订劳动合同：公司应提供完整的劳动合同存档记录，证明其中不包含该员工的合同。同时，可以核实该员工是否与其他单位签订了劳动合同，以进一步确认其劳动关系归属。
- 合同终止或解除：若该员工曾与公司签订劳动合同，但合同已终止或解除且未续签，公司应保留相关终止或解除合同的证明文件，如终止/解除劳动合同通知书、员工签收记录等。
社会保险和公积金缴纳记录：
- 公司应查询社保经办机构和住房公积金管理中心提供的缴纳明细清单，证明清单中无该员工的缴纳信息。这可以辅助证明公司未为其缴纳社保和公积金，从而不存在劳动关系。
二、工作管理层面
工资发放记录：
- 公司应查看财务记录，包括工资发放银行流水、工资表等，证明无该员工的工资支付信息。这表明公司未向其支付劳动报酬，不符合劳动关系的特征。
工作安排与考勤记录：
- 工作安排：公司应检查工作邮件、任务分配单、项目计划书等文件，证明均不涉及该员工的工作分配内容。
- 考勤记录：公司应提供考勤系统的原始数据，如打卡记录、签到表等，证明其中无该员工的考勤信息。这表明其未接受公司的日常出勤管理。
三、员工信息管理层面
- 员工信息系统查询：
- 公司应检查员工信息系统，包括人力资源管理系统、内部通讯录、员工名单等，证明系统中无该员工的相关信息，或信息与实际情况不符。
四、其他证据层面
员工声明：
- 如可能，公司可以让该员工出具书面声明，明确表示其与公司不存在劳动关系。声明应包含员工的基本信息及清晰的声明表述，并签字、按手印。
证人证言：
- 公司其他员工的证人证言也可作为辅助证据。公司可以让了解情况的员工出具书面证言，证明该员工从未在公司工作过，或在工作场合中从未见过该员工。
综合其他证明材料：
- 公司可以收集公司内部的通讯录、员工名单、工作场所监控视频等其他相关材料作为辅助证明。例如，如果工作场所的监控视频显示该员工从未在公司出现过，这也可以作为证明其非公司员工的证据。
五、法律途径与注意事项
申请政府信息公开（如适用）：
- 在某些情况下，公司可以向相关部门申请政府信息公开，获取特定人员的任职信息。但这通常适用于公职人员或涉及公共利益的情况。
确保证据的合法性和真实性：
- 在收集和使用证据时，公司必须严格遵守法律法规，确保证据的合法性和真实性。不得伪造、篡改证据或使用非法手段获取证据。
及时保存和备份证据：
- 为避免证据丢失或被篡改，公司应及时将证据进行保存和备份。同时，确保在使用时能够迅速找到并提供给相关部门或人员。
在实际操作中，公司应根据具体情况选择合适的证据收集方式，并确保证据的充分性和合法性。如果公司在证明过程中遇到困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据公司的具体情况提供专业的法律建议。