结论前置：节假日上班三倍工资被扣掉一般是不合理的，员工有权要求用人单位按照法律规定支付相应的加班工资。
法律背景与解释：
法定节假日加班工资的规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这意味着，在法定节假日上班，员工应获得三倍于日常工资的加班费。
扣减节假日加班工资的合理性分析：
- 用人单位扣减节假日上班的三倍工资，通常缺乏法律依据，除非存在特定的合同约定或规章制度，且这些约定或制度不违反法律法规的强制性规定。但即便有合同约定或规章制度，如果其内容违反了劳动法关于加班工资的规定，也是无效的。
- 在实践中，如果用人单位未按照法律规定支付节假日加班工资，员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动争议仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
法律建议：
与用人单位沟通：
- 如果发现节假日上班的三倍工资被扣减，首先可以尝试与用人单位进行沟通，了解扣减的原因，并要求用人单位按照法律规定支付加班工资。
收集证据：
- 在与用人单位沟通的同时，注意收集相关证据，如考勤记录、工资条、劳动合同等，以证明自己在节假日上班且未获得相应的加班工资。
寻求法律援助：
- 如果与用人单位沟通无果，或者用人单位拒绝支付加班工资，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者咨询专业律师，通过劳动争议仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果用人单位未按照法律规定支付节假日加班工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付加班工资、加付赔偿金等。
- 同时，用人单位还可能因违反劳动法律法规而损害其声誉，影响其与员工的劳动关系和未来的招聘工作。
举例说明：
- 假设某员工在国庆节期间上班，其日常工资为200元/天。根据法律规定，该员工在国庆节上班应获得600元/天的加班工资（即200元/天 * 3）。如果用人单位只支付了200元/天的工资，扣减了400元/天的加班工资，那么这种行为就是违法的，员工有权要求用人单位支付剩余的加班工资。
总结与进一步思考：
- 节假日上班三倍工资被扣减一般是不合理的，员工应了解自己的权益并积极维护。
- 在面对此类问题时，员工应保持冷静，通过合法途径解决问题，避免采取过激行为。
- 同时，用人单位也应遵守劳动法律法规，合理支付员工的加班工资，以维护良好的劳动关系和企业形象。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。