公司发生重大损失后的赔偿问题，需结合损失原因、责任归属及合同约定等因素综合判断。以下是具体分析：

1. 若损失由员工过错导致

   • 赔偿原则：根据《民法典》第1165条，员工因故意或重大过失造成公司损失的，公司可要求其赔偿实际损失。
     
   • 限制条件：赔偿金额通常不超过劳动者当月工资的20%（《工资支付暂行规定》第16条），且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
     
   • 例外情形：若员工行为构成犯罪（如职务侵占），公司可报警并追究刑事责任，同时通过民事诉讼索赔。

2. 若损失由第三方侵权导致

   • 直接索赔：公司可依据《民法典》第1184条，要求侵权方赔偿直接经济损失（如财产毁损、经营中断损失）。
     
   • 间接损失：若能证明侵权行为与间接损失（如预期利润减少）存在因果关系，可一并主张，但需承担较高举证责任。
     
   • 保险理赔：若公司投保了财产险或责任险，可优先向保险公司申请理赔，再由保险公司向侵权方追偿。

3. 若损失由合同相对方违约导致

   • 合同约定优先：若合同中明确约定了违约责任（如违约金、损失赔偿计算方式），可直接依据合同主张。
     
   • 法定赔偿：无约定时，可依据《民法典》第584条，要求赔偿因违约造成的实际损失，包括合同履行后可获得的利益（需合理预见）。
     
   • 减损义务：公司需证明已采取合理措施防止损失扩大，否则扩大部分可能无法获赔。

4. 若损失由不可抗力或意外事件导致

   • 免责情形：根据《民法典》第180条，因不可抗力（如自然灾害、战争）不能履行合同的，部分或全部免除责任，但需及时通知对方并提供证明。
     
   • 例外情形：若合同明确约定排除不可抗力免责（如某些特许经营合同），则仍需赔偿。

行动建议：

1. 立即固定证据（如损失清单、监控录像、合同文本、沟通记录）；
   
2. 评估损失金额及责任主体，优先通过协商或保险理赔解决；
   
3. 若协商无果，需在3年诉讼时效内（自知道权利受损之日起）提起诉讼或仲裁。
   

如有具体场景或合同条款，可进一步提供细节，我会帮你分析责任划分及赔偿方案。