结论前置：工程发包给自然人的建设工程合同无效后，建设工程款的支付问题需根据工程竣工验收情况来具体判断。若工程验收合格，发包方应支付工程价款；若验收不合格，则需视修复情况及合同无效原因来具体处理。

一、合同无效但工程验收合格的情况

当建设工程施工合同无效，但建设工程经验收合格时，根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，发包方仍需参照合同关于工程价款的约定折价补偿承包人。这是因为，尽管合同无效，但承包人已经付出了劳动和成本，且工程成果符合要求，因此支付相应的工程价款符合公平原则。

举例说明：假设某工程发包给了一位自然人承包，双方签订的合同因承包人无资质而无效。但工程完工后，经过验收，质量合格。此时，发包方仍需按照合同约定的价款支付给承包人。

二、合同无效且工程验收不合格的情况

1. 可修复且修复后合格：
   • 若建设工程经修复后验收合格，发包方在支付工程价款时，有权请求承包人承担修复费用。即发包方需支付扣除修复费用后的工程价款。

举例说明：上述工程在验收时发现存在质量问题，但经过修复后合格。此时，发包方在支付工程价款时，可以扣除修复费用后支付给承包人。

1. 不可修复或修复后仍不合格：
   • 若建设工程无法修复或修复后仍验收不合格，承包人无权请求参照合同关于工程价款的约定折价补偿。此时，发包方通常无需支付工程价款。但若发包方对建设工程不合格造成的损失有过错，应承担相应的责任。

举例说明：若上述工程因设计问题或材料问题导致无法修复或修复后仍不合格，且发包方对此有过错（如提供了错误的设计图纸或劣质材料），则发包方需承担相应的责任，可能包括支付部分工程价款或赔偿承包人的损失。

1. 合同无效原因归责于承包人：
   • 如合同无效是因承包人无资质或超越资质等级等自身原因所致，发包方有权不支付工程价款，或仅支付部分款项以补偿承包人的实际损失。这体现了法律对合同双方诚信及资质的严格要求。

举例说明：若承包人明知自己无资质仍承接工程，导致合同无效，且工程验收不合格。此时，发包方有权不支付工程价款，或仅支付承包人实际投入的成本等部分款项。

三、综合建议

在处理此类纠纷时，建议发包方和承包方：

1. 谨慎审查对方资质：在签订合同时，应仔细审查对方的资质和信誉，确保合同有效，以避免后续不必要的法律纠纷和经济损失。

2. 严格履行合同约定：在工程施工过程中，双方应严格履行合同约定，确保工程质量，以减少验收不合格带来的法律风险和经济负担。

3. 及时咨询专业律师：若发生纠纷，应及时咨询专业律师，了解自身权益和义务，以便采取合适的法律措施维护自身权益。

作为程亚律师，我专注于婚姻家庭、合同纠纷领域，如果你有任何相关法律问题，都可以直接向我咨询。