政府行政审批手续在一般情况下不能直接对抗当事人之间的约定，但存在例外情况。以下从不同角度进行详细分析：
一、一般原则：合同自由与意思自治
在民事法律关系中，合同自由和意思自治是基本原则。当事人之间基于平等、自愿的原则订立的合同，对双方具有法律约束力。这意味着，除非合同内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，否则合同应当得到履行。因此，在一般情况下，政府行政审批手续不能直接改变或否定当事人之间的约定。
二、例外情况：法律、行政法规的强制性规定
尽管合同自由和意思自治是基本原则，但法律、行政法规的强制性规定具有更高的法律效力。如果当事人之间的约定违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该约定将被视为无效。在这种情况下，政府行政审批手续可能成为判断合同效力的关键因素。例如，某些行业或领域的经营活动需要获得政府的特别许可或审批，如果当事人未获得相关审批手续而擅自开展经营活动，其签订的合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
三、行政审批与合同履行的关系
行政审批作为合同生效条件：在某些情况下，当事人可能约定将行政审批作为合同生效的条件。这意味着，只有获得相关行政审批后，合同才正式生效。在这种情况下，政府行政审批手续对合同的履行具有直接影响。如果未能获得审批，合同可能无法履行或被视为未生效。
行政审批作为合同履行障碍：即使合同已经生效，行政审批也可能成为合同履行的障碍。例如，如果合同涉及需要政府审批的项目或活动，而审批过程中出现问题或延误，可能导致合同无法按时履行。在这种情况下，当事人需要协商解决或寻求法律救济，以应对行政审批带来的履行障碍。
四、法律建议
在签订合同时明确行政审批条款：为了避免因行政审批问题引发的纠纷，当事人在签订合同时应明确约定行政审批的相关条款，包括审批的义务主体、审批期限、审批不通过的处理方式等。
及时关注行政审批进展：在合同履行过程中，当事人应及时关注行政审批的进展情况，确保审批手续能够按时完成。如果审批过程中出现问题或延误，应及时与对方沟通并协商解决方案。
寻求法律救济：如果因行政审批问题导致合同无法履行或产生纠纷，当事人可以寻求法律救济。根据具体情况，可以选择协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。
如有任何关于政府行政审批手续与合同约定的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。