企业未通过员工同意扣款，这种行为通常是违法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景与规定

根据《中华人民共和国劳动法》以及《工资支付暂行规定》等相关法律法规，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，企业不得随意克扣。企业若要扣款，必须基于合法、合理且事先与员工协商一致的原则。具体来说，合法的扣款情形通常包括：

1. 代扣代缴个人所得税：企业作为扣缴义务人，需依法代扣员工的个人所得税。
2. 代扣代缴社会保险费用：企业需按照法律规定，为员工代扣代缴社会保险费用。
3. 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费：在特定法律程序下，企业可能需根据法院判决或裁定代扣相关费用。
4. 因员工本人原因给企业造成经济损失的赔偿：但这种情况下，企业扣款也需遵循一定限制，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

违法扣款的情形

若企业未经员工同意，擅自扣款，且不属于上述合法扣款情形，则构成违法。这种行为可能侵犯员工的合法权益，员工有权要求企业返还被扣款项，并可能因此向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

法律建议与后果

1. 对于员工：

   • 若发现企业未经同意扣款，首先应与企业沟通，了解扣款原因，并要求企业提供合法依据。
   • 若沟通无果，可向当地劳动监察部门投诉，或依法提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

2. 对于企业：

   • 应严格遵守相关法律法规，不得随意扣款。若需扣款，应事先与员工协商一致，并明确告知扣款原因、金额及期限。
   • 若因员工原因造成经济损失，需扣款赔偿时，应确保扣款金额合法合理，并遵循相关限制规定。
   • 违法扣款可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等，同时可能损害企业形象，影响员工士气。

举例说明：假设某企业因员工迟到而擅自扣款，且未事先与员工协商一致，也未在劳动合同或规章制度中明确规定迟到扣款的条款。这种情况下，企业的扣款行为就是违法的，员工有权要求企业返还被扣款项。

综上所述，企业未经员工同意扣款通常是违法的。若你遇到类似情况，或有其他劳动工伤（工资福利）方面的问题，欢迎直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。