公司以不服从安排为由进行扣款，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
劳动合同与规章制度的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。劳动合同中应明确工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等关键条款。
- 如果公司的规章制度中明确规定了不服从工作安排将受到何种处罚，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，同时不违反法律、行政法规及政策规定，那么公司依据规章制度进行扣款可能是合法的。但即便如此，扣款金额也应合理，不能超出劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
扣款合理性的角度：
- 即使公司有规章制度作为依据，扣款也必须合理。如果扣款金额过高，或者扣款行为缺乏合理性（如因轻微不服从安排就进行高额扣款），那么这种扣款行为可能被视为违法。
- 劳动者有权拒绝公司的不合理要求，如果公司因此进行扣款，劳动者可以通过法律途径维护自己的权益。
法律后果的角度：
- 如果公司违法扣款，劳动者可以向劳动监察部门投诉，要求公司改正并补发被扣的工资。
- 劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付违法扣款的赔偿金。在仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据证明公司的扣款行为违法。
建议：
- 对于劳动者而言，如果公司以不服从安排为由进行扣款，首先应查看劳动合同和公司规章制度中是否有相关规定，并评估扣款的合理性。如果认为扣款违法或不合理，可以与公司协商解决；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应确保规章制度合法合规，并在制定和执行过程中充分尊重劳动者的权益。扣款应基于合理的原因和金额，避免引发劳动争议和法律风险。
示例：
假设某公司规章制度中规定，员工不服从工作安排将扣除当月工资的10%。如果某员工因轻微不服从安排被扣除10%的工资，且扣除后的工资不低于当地最低工资标准，那么这种扣款行为可能是合法的。但如果公司因员工轻微不服从安排就扣除50%的工资，那么这种扣款行为就可能被视为违法。
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