事业单位人员有违纪行为，其立案依据主要来源于相关的法律法规以及事业单位内部的规章制度。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律法规依据：

   • 《中华人民共和国监察法》：该法规定了监察机关对公职人员（包括事业单位人员）的监察职责，对于涉嫌违纪违法的行为，监察机关有权进行调查并立案。虽然《监察法》并未直接规定立案的具体标准，但它为立案提供了法律基础和程序框架。
   • 《中华人民共和国公职人员政务处分法》：此法明确了公职人员违纪违法的行为种类和相应的政务处分措施。当事业单位人员有违纪行为时，可以依据该法进行立案调查，并根据调查结果给予相应的政务处分。

2. 事业单位内部规章制度依据：

   • 事业单位通常会根据自身的特点和需要，制定一系列内部规章制度，包括员工行为规范、纪律处分条例等。这些规章制度是事业单位对员工进行日常管理和纪律处分的重要依据。
   • 当事业单位人员违反这些规章制度时，事业单位有权依据内部规定进行立案调查，并根据调查结果给予相应的纪律处分。

3. 立案的具体流程：

   • 发现违纪行为：事业单位或其上级主管部门在日常工作中发现员工有违纪行为，或者接到相关举报、投诉。
   • 初步调查：对涉嫌违纪的行为进行初步调查，收集相关证据，了解事实情况。
   • 立案决定：根据初步调查结果，如果认为有立案的必要，由事业单位或其上级主管部门作出立案决定，并成立专门的调查组进行深入调查。
   • 深入调查与处理：调查组对违纪行为进行深入调查，收集充分证据，形成调查报告。根据调查报告，事业单位或其上级主管部门作出处理决定，包括给予纪律处分、移送司法机关等。

4. 注意事项：

   • 在立案过程中，必须严格遵守法律法规和事业单位内部规章制度的规定，确保程序的合法性和公正性。
   • 立案调查应当全面、客观、公正，收集证据应当合法、有效，避免侵犯员工的合法权益。
   • 对于涉嫌违纪违法的行为，应当及时立案调查，避免拖延导致证据灭失或案情复杂化。

总结来说，事业单位人员有违纪行为的立案依据主要来源于相关的法律法规以及事业单位内部的规章制度。在立案过程中，必须严格遵守法定程序和内部规定，确保程序的合法性和公正性。如果您或您身边的人遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。