员工因子宫肌瘤手术休假，通常应按病假处理，薪资待遇根据病假工资规定及公司制度确定。以下从不同角度详细说明：
病假认定角度
子宫肌瘤手术属于因患病需要停止工作医疗的情形，符合《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》中“医疗期”的认定条件。员工需提供医院出具的《病假证明单》、诊断证明、病历等材料，公司审核通过后应按病假处理。若公司无正当理由拒绝认定病假，可能涉嫌违法。
薪资待遇角度
- 病假工资标准：根据《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第59条，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。具体比例需结合地方规定（如上海明确病假工资按工龄分档计算，最低为本人工资的60%）。
- 公司制度补充：若公司规章制度或劳动合同中约定了更高的病假工资标准（如全额发放），应优先适用约定；若约定低于法定标准，则以法定标准为准。
- 医疗期长度影响：医疗期长短根据工龄和在本单位工作年限确定（如3-24个月），医疗期内公司不得解除劳动合同，且需支付病假工资；医疗期满后若仍不能工作，公司可按《劳动合同法》第40条解除合同并支付经济补偿。
特殊情形提示
- 产假与病假区分：若手术与生育相关（如孕期发现肌瘤需提前剖宫产），可能涉及产假待遇，需根据《女职工劳动保护特别规定》处理，产假工资通常高于病假工资。
- 医疗期满处理：医疗期满后仍不能从事原工作或公司另行安排的工作的，公司需提前30日书面通知或额外支付1个月工资后解除合同，并支付经济补偿（N倍工资）。
建议：员工应保留完整医疗证明，公司应依法制定病假管理制度。如有争议，可携带劳动合同、病假材料等向我进一步咨询，我将结合地方规定和具体案情为您分析。