结论：员工离职没做好交接，一般情况下不可以直接扣工资，但在特定条件下，用人单位可以扣除部分工资作为赔偿，且扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，同时扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

详细分析：

1. 一般原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，除非有法定或约定的理由，否则用人单位不得随意扣除劳动者的工资。

2. 特定条件下的扣除：

   • 如果员工离职时未按照约定或公司规定完成交接工作，且给用人单位造成了经济损失，用人单位在有证据证明的情况下，可以要求员工赔偿。但这种赔偿通常不是直接通过扣工资来实现，而是需要通过协商、调解、仲裁或诉讼等法律程序来确定赔偿金额和方式。
   • 在某些情况下，如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工离职时未完成交接工作的赔偿方式和金额，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以按照约定扣除部分工资作为赔偿。但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，同时扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

3. 实际操作建议：

   • 完善规章制度：用人单位应在劳动合同或公司规章制度中明确规定员工离职时的交接义务和未完成交接的赔偿责任，以便在发生争议时有据可依。
   • 保留证据：用人单位应保留员工未完成交接工作的相关证据，如交接清单、工作记录、损失证明等，以便在需要时证明员工的违约行为和给用人单位造成的损失。
   • 合法合规操作：在扣除工资时，用人单位应确保扣除的金额和方式符合法律法规的规定，避免因违法操作而引发劳动争议。

4. 法律后果：

   • 如果用人单位未经合法程序或违反法律法规的规定扣除员工工资，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付被扣除的工资及可能的赔偿金。

举例说明： 假设某员工离职时未按照公司规定完成交接工作，导致公司遭受了5000元的经济损失。如果公司规章制度中明确规定了此类情况的赔偿责任，并且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以与员工协商赔偿事宜。如果协商不成，公司可以通过法律程序要求员工赔偿。在赔偿金额确定后，如果公司决定从员工工资中扣除赔偿金，那么扣除的金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

总结与建议： 员工离职没做好交接，用人单位不能直接扣工资，但在特定条件下可以扣除部分工资作为赔偿。为避免劳动争议，用人单位应完善规章制度、保留证据并合法合规操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。