已经立案的交通事故案件，在交通运输执法部门负责人批准后予以结案的情形，通常包括以下几种：

1. 事故责任明确，且已达成赔偿协议：

   • 当交通事故的责任已经明确划分，且事故双方或多方已经就赔偿事宜达成一致，并签订了赔偿协议时，交通运输执法部门在审核确认协议内容合法、合理后，可以经负责人批准予以结案。这种情况下，结案意味着事故的法律后果已经通过协商得到妥善解决。

2. 事故责任明确，且赔偿已履行完毕：

   • 如果事故责任已经明确，且责任方已经按照法律规定或赔偿协议履行了全部赔偿义务，包括支付赔偿金、修复受损财产等，交通运输执法部门在确认赔偿已到位后，可以经负责人批准结案。这标志着事故的经济赔偿部分已经得到圆满解决。

3. 事故责任无法查清，但双方无争议：

   • 在某些情况下，尽管交通运输执法部门尽力调查，但事故责任可能仍然无法完全查清。如果事故双方或多方对此表示无异议，并同意结案，交通运输执法部门在评估后认为不会引发后续纠纷的，可以经负责人批准予以结案。这种情况下，结案更多是基于双方的和解与妥协。

4. 事故涉及刑事犯罪，已移送司法机关处理：

   • 如果交通事故涉及刑事犯罪，如交通肇事罪等，交通运输执法部门在初步调查后，会将案件移送至司法机关（如公安局、检察院等）进行进一步处理。在移送后，交通运输执法部门可以经负责人批准结案，因为后续的法律程序将由司法机关负责。

5. 其他法定或约定结案情形：

   • 除了上述情形外，还可能存在其他由法律、法规或双方约定导致的结案情形。例如，如果事故双方同意通过仲裁或调解方式解决纠纷，并在达成仲裁裁决或调解协议后，交通运输执法部门在确认其效力后，可以经负责人批准结案。

在结案过程中，交通运输执法部门会遵循严格的法律程序和规定，确保结案的合法性和合理性。同时，结案并不意味着事故的所有法律后果都已完全消除，如果后续发现新的证据或事实，可能仍然需要重新启动调查或处理程序。

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