事业单位工作人员不服从工作安排，单位一般不可以直接扣发工资，但需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、法律法规层面
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，工资是劳动者因提供劳动而应获得的报酬，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。除非劳动者存在严重违反规章制度、失职等情形，且规章制度中明确规定了相应的处罚措施（包括扣发工资），否则用人单位不得随意扣发工资。
对于事业单位工作人员，虽然其管理可能受到《事业单位人事管理条例》等特定规定的约束，但这些规定同样强调了对工作人员合法权益的保护，并未授权单位在工作人员不服从工作安排时直接扣发工资。
二、实际操作层面
不服从工作安排的性质：
- 如果工作人员的不服从行为是轻微的、偶发的，且未对单位造成实质性损害，单位通常不会采取扣发工资等严厉措施。
- 如果工作人员的不服从行为是严重的、持续的，且对单位造成了实质性损害，单位可能会依据内部规章制度或相关法律法规，采取包括扣发工资在内的处罚措施。
内部规章制度的制定与执行：
- 事业单位通常会有内部规章制度，明确工作人员的权利与义务，以及违反规定的处罚措施。
- 如果规章制度中明确规定了不服从工作安排可以扣发工资，且该规章制度已经过合法程序制定并公示，那么单位在执行时可能具有一定的合法性。但即便如此，扣发工资的幅度和期限也应合理，不能过度侵犯工作人员的合法权益。
劳动争议处理：
- 如果工作人员对单位的扣发工资决定不服，可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
- 在处理劳动争议时，仲裁机构或法院会综合考虑双方的行为、规章制度的内容以及法律法规的规定，作出公正的裁决。
三、建议与注意事项
对于事业单位：
- 在制定内部规章制度时，应明确不服从工作安排的具体情形和相应的处罚措施，确保规章制度的合法性和合理性。
- 在执行规章制度时，应遵循公平、公正、公开的原则，避免过度侵犯工作人员的合法权益。
对于工作人员：
- 应遵守单位的规章制度和工作安排，积极履行自己的工作职责。
- 如果对单位的决定有异议，应通过合法途径表达自己的诉求，避免采取过激行为。
- 如果遭遇不公正的扣发工资决定，应及时寻求法律援助或提起劳动争议仲裁/诉讼。
总结来说，事业单位工作人员不服从工作安排时，单位一般不可以直接扣发工资。但如果工作人员的行为严重违反了规章制度或相关法律法规，且规章制度中明确规定了相应的处罚措施（包括扣发工资），那么单位在执行时可能具有一定的合法性。不过，即便如此，扣发工资的幅度和期限也应合理，不能过度侵犯工作人员的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。