结论：外包人员规章制度中迟到早退一次扣50元是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 规章制度合法性基础：

   • 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定有关劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定。若外包公司未遵循此民主程序制定规章制度，则该制度可能因程序违法而无效，其中关于迟到早退扣款的条款也可能随之无效。

2. 扣款合法性判断：

   • 扣款金额合理性：即便规章制度合法，扣款金额也需合理。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。若迟到早退一次扣50元，需结合劳动者月工资水平及当地最低工资标准判断是否合法。例如，若劳动者月工资为2000元，扣除50元后剩余工资为1950元，未低于当地最低工资标准，且扣除比例未超过20%，则可能合法；反之，则可能违法。
   • 扣款与损失关联性：扣款应与劳动者迟到早退给用人单位造成的实际损失相当。若迟到早退未给用人单位造成实际损失，或损失远小于50元，则扣款可能缺乏合理性，构成违法。

3. 劳动合同约定：

   • 若劳动合同中明确约定了迟到早退的扣款标准，且该标准不违反法律法规的强制性规定，则双方应按合同约定履行。但需注意，劳动合同中的约定也不能违反民主程序制定的规章制度中的合法条款。

4. 实际操作建议：

   • 对于劳动者：若认为规章制度或扣款行为违法，可先与用人单位协商解决；协商不成，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
   • 对于用人单位：应确保规章制度的制定程序合法，扣款金额合理且与实际损失相当，并在劳动合同中明确约定相关条款，以避免法律风险。

总结：外包人员规章制度中迟到早退一次扣50元是否违法，需结合规章制度的制定程序、扣款金额的合理性、与实际损失的关联性以及劳动合同的约定等多方面因素综合判断。若您对此有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。