如果交通事故中的二次鉴定结果推翻了第一次鉴定，可以按照以下步骤处理：

1. 接受并理解鉴定结果的变化
   首先需要明确，鉴定结果本身是具有专业性和科学性的，二次鉴定推翻第一次鉴定并不罕见。这可能是由于第一次鉴定时证据不足、技术手段有限，或者二次鉴定时发现了新的证据或采用了更先进的技术。因此，不必对结果的变化感到过度焦虑，而是应理性分析两次鉴定的差异及原因。

2. 分析两次鉴定的差异点
   需要仔细对比两次鉴定报告的内容，重点关注以下方面：

   • 鉴定依据：两次鉴定是否基于相同的证据材料？二次鉴定是否补充了新的证据（如监控录像、车辆痕迹、医疗记录等）？
     
   • 技术方法：两次鉴定是否采用了相同的技术手段？例如，伤情鉴定可能涉及不同的医学检查方法（如CT、MRI等），车辆损失鉴定可能涉及不同的评估标准。
     
   • 鉴定机构资质：两次鉴定的机构是否均具备合法资质？二次鉴定机构是否在相关领域具有更高的权威性或更先进的技术？
     
   • 鉴定人专业背景：两次鉴定的鉴定人是否具备相应的专业资质和经验？是否存在利益冲突或主观偏见？
     

3. 根据鉴定结果调整诉讼策略
   鉴定结果是交通事故赔偿案件中的核心证据之一，二次鉴定推翻第一次鉴定后，诉讼策略可能需要相应调整：

   • 如果二次鉴定对您更有利：例如，二次鉴定认定伤情更重或车辆损失更大，您可以在诉讼中主张以二次鉴定结果为准，要求对方承担更高的赔偿责任。
     
   • 如果二次鉴定对对方更有利：例如，二次鉴定认定伤情较轻或车辆损失较小，您需要重新评估诉讼风险。如果第一次鉴定存在明显瑕疵（如程序违法、依据不足等），可以尝试申请重新鉴定或质疑二次鉴定的合法性；如果二次鉴定程序合法、依据充分，您可能需要考虑调解或接受较低的赔偿金额。
     

4. 考虑申请重新鉴定或专家辅助人参与
   如果对二次鉴定结果仍有异议，可以采取以下措施：

   • 申请重新鉴定：根据《民事诉讼法》和《司法鉴定程序通则》，当事人对鉴定意见有异议的，可以申请重新鉴定。但需注意，重新鉴定需满足法定条件（如鉴定机构或鉴定人不具备资质、鉴定程序违法、鉴定意见明显依据不足等），否则法院可能不予准许。
     
   • 申请专家辅助人参与：在诉讼中，您可以聘请相关领域的专家作为“专家辅助人”，对鉴定意见进行质证或提出专业意见，帮助法院更全面地理解鉴定结果。
     

5. 与对方协商或通过法院调解
   如果两次鉴定结果差异较大，导致赔偿金额难以确定，可以尝试与对方协商或通过法院调解解决纠纷。调解的优势在于效率高、成本低，且双方可以在法律框架内灵活协商赔偿方案。

总结：二次鉴定推翻第一次鉴定时，关键在于理性分析两次鉴定的差异点，并根据鉴定结果调整诉讼策略。如果对二次鉴定有异议，可以通过申请重新鉴定或引入专家辅助人维护自身权益。如果问题复杂，建议直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供更详细的法律建议。