针对您提出的“员工怀孕后再入职新公司怎么办”的问题，这确实是一个涉及劳动法、妇女权益保护以及职场公平性的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，从法律层面来看，怀孕女性作为劳动者，享有与其他劳动者同等的平等就业权，这一权利受到法律的严格保护。根据《就业促进法》和《妇女权益保障法》的相关规定，用人单位在招录过程中，除国家另有规定外，不得将妊娠测试作为入职体检项目，也不得以性别或怀孕为由拒绝录用妇女或提高对妇女的录用标准。
接下来，针对您提到的具体情况，即员工在怀孕后再入职新公司，这里有几个关键点需要注意：
入职前的孕检要求：
- 用人单位无权要求应聘者在入职前进行孕检，这是侵犯劳动者平等就业权的行为。应聘者有权拒绝此类要求，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
入职后的孕期保护：
- 如果员工在入职后怀孕，用人单位应当按照相关法律法规的规定，对孕期女职工给予特殊保护。这包括不安排孕期禁忌从事的劳动、根据医疗机构诊断证明减轻劳动量或安排其他适应的劳动、在劳动时间内进行产前检查的时间计入劳动时间等。
- 对于怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长其劳动时间或安排夜班劳动，并应在每天劳动时间内安排不少于1小时的休息时间。
入职后怀孕的处理方式：
- 如果员工在入职后发现自己怀孕，应及时告知用人单位，以便用人单位根据法律法规和公司政策进行相应调整。
- 用人单位应积极与员工沟通，了解其身体状况和工作需求，共同协商制定合理的工作安排，确保员工的健康和工作的顺利进行。
法律责任与风险防范：
- 用人单位如果违反相关法律法规，如要求入职前孕检、因怀孕而拒绝录用或解除劳动合同等，将承担法律责任，包括赔偿损失、恢复劳动关系等。
- 因此，用人单位应加强法律意识，完善招聘和用工管理制度，确保在招聘和用工过程中遵守相关法律法规，避免法律风险。
最后，我想强调的是，职场应该是一个公平、包容和尊重多元的环境。怀孕是女性员工的个人隐私和基本权利，用人单位应该以开放和包容的态度对待怀孕员工，为她们提供必要的支持和帮助，共同营造一个和谐、积极的职场氛围。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。