公司工伤认定不合法，通常可能涉及以下几个方面的原因：

1. 认定程序不合法：

   • 未及时申请：根据《工伤保险条例》第十七条，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果公司未在规定时间内提出申请，且未给出合理理由，那么其工伤认定程序就可能被视为不合法。
   • 申请材料不齐全或虚假：公司在申请工伤认定时，需要提交一系列的材料，如工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系（包括事实劳动关系）的证明材料、医疗诊断证明或者职业病诊断证明书（或者职业病诊断鉴定书）等。如果公司提交的材料不齐全或者存在虚假情况，那么其工伤认定申请就可能被驳回，且认定程序不合法。

2. 认定事实不准确：

   • 事故原因认定错误：在工伤认定过程中，需要准确认定事故的原因和性质。如果公司或者社会保险行政部门在认定过程中，对事故的原因或性质认定错误，比如将非工作原因造成的事故误认为是工作原因造成，那么其工伤认定就可能不合法。
   • 忽视关键证据：在工伤认定过程中，需要综合考虑各种证据，包括现场勘查记录、证人证言、医疗记录等。如果公司或者社会保险行政部门在认定过程中忽视了关键证据，或者对证据的解读存在偏差，那么其工伤认定结果就可能不准确，进而被视为不合法。

3. 适用法律错误：

   • 错误适用法规：在工伤认定过程中，需要正确适用相关的法律法规。如果公司或者社会保险行政部门在认定过程中错误地适用了法律法规，比如将应适用《工伤保险条例》的情形错误地适用了其他法规，那么其工伤认定就可能不合法。
   • 对法规理解有误：有时候，即使适用了正确的法规，但如果对法规的理解存在偏差，也可能导致工伤认定不合法。比如，对“工作时间”、“工作场所”、“工作原因”等概念的理解存在偏差，就可能影响工伤认定的结果。

针对公司工伤认定不合法的情况，你可以采取以下措施：

• 与公司沟通：首先，你可以尝试与公司进行沟通，了解公司工伤认定不合法的原因，并尝试协商解决。如果公司愿意纠正错误并重新进行工伤认定，那么问题可能得到妥善解决。
• 申请行政复议或提起行政诉讼：如果与公司沟通无果，你可以向社会保险行政部门申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼，要求撤销不合法的工伤认定决定，并重新进行工伤认定。

在处理工伤认定问题时，建议你注意以下几点：

• 及时收集证据：在事故发生后，及时收集并保存相关证据，如现场照片、证人证言、医疗记录等，以便在工伤认定过程中提供有力的支持。
• 了解相关法律法规：熟悉并了解《工伤保险条例》等相关法律法规，以便在工伤认定过程中能够正确维护自己的权益。
• 寻求专业帮助：如果你对工伤认定程序或相关法律法规不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地处理工伤认定问题。

如果你在处理工伤认定问题时遇到任何疑问或困难，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。