申请工伤鉴定并不需要等待治疗期结束。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律规定角度
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
从这些规定可以看出，工伤认定的申请期限是从事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起计算的，并不以治疗期是否结束为前提。也就是说，无论职工是否处于治疗阶段，这个申请期限都会持续计算。
二、实际操作角度
在实际操作中，即使治疗尚未结束，也可以先申请工伤认定。比如，当伤情相对稳定，能够初步判断符合工伤情形时，就可以着手准备申请材料。例如，某建筑工人从高处坠落导致腿部骨折，经过一段时间的紧急治疗后，虽然还需要后续康复，但此时已经可以明确该事故是在工作时间和工作场所内因工作原因导致的，那么就可以及时申请工伤认定，不必等到完全康复后再申请。
三、医疗期与工伤鉴定的关系
医疗期在工伤领域常被称为“停工留薪期”，指职工因工作遭受事故伤害或患职业病需暂停工作接受治疗的期限。根据《工伤保险条例》，停工留薪期一般不超过12个月，特殊情况下可延长至24个月（含原期限）。工伤职工评定伤残等级后，虽停发原待遇转而享受伤残待遇，但这并不直接等同于医疗期结束。
工伤鉴定是对职工所受伤害的性质、程度及与工作关联性的医学技术鉴定，而医疗期的长短并非由工伤鉴定结果直接决定，而是依据职工实际治疗需求和恢复情况来确定。因此，即使工伤鉴定完成，若职工经医疗机构证明仍需继续治疗以促进康复或处理后续病症，医疗期仍可继续。
四、特殊情况考虑
虽然一般情况下申请期限是固定的，但也存在一些特殊情况。例如，如果因为不可抗力、人身自由受到限制、属于用人单位原因、社会保险行政部门登记制度不完善，或者当事人对是否存在劳动关系申请仲裁、提起民事诉讼等情形而耽误了时间，那么这些被耽误的时间将不计算在工伤认定申请期限内。
五、建议与总结
综上所述，申请工伤鉴定并不需要等待治疗期结束。职工应根据自身实际情况和法律规定，及时提出工伤认定申请，并保留好相关证据，以维护自己的合法权益。