申请离职后擅自离职，对员工个人而言具有多方面的负面影响，包括对当前劳动关系、再就业、劳动权益保障以及个人职业发展等方面的潜在风险。以下是对此问题的详细分析：
一、对当前劳动关系的影响
工资结算与赔偿责任：
- 擅自离职可能导致用人单位依据规章制度扣除一定比例的工资，特别是当擅自离职给单位造成生产经营损失时，单位有权从工资中扣除相应赔偿，但扣除后不得低于当地最低工资标准。同时，单位可能拖延或拒绝支付未结算工资，劳动者需花费时间和精力追讨。
- 从法律层面讲，擅自离职可能构成违法解除劳动合同，员工可能需要承担支付违约金或赔偿金的责任，以弥补公司因擅自离职造成的经济损失。
社保和公积金中断：
- 擅自离职后，社保和公积金通常会停缴，若未及时办理相关手续，可能导致缴费混乱。社保中断可能影响医保报销等权益，公积金中断则可能影响贷款申请资格和额度。
二、对再就业的影响
离职证明与背景调查：
- 擅自离职可能导致难以获得原单位的离职证明，新单位在招聘时通常要求此证明以确认工作经历和劳动关系解除情况。缺乏离职证明可能引发新单位对求职者诚信和职业素养的怀疑，影响录用决策。
- 在背景调查中，原单位可能如实反馈擅自离职情况，给求职者在新单位的形象和评价带来负面影响，降低获得新工作机会的可能性。
职业声誉与发展：
- 擅自离职行为可能对员工的职业声誉造成损害，新雇主可能对其责任感和稳定性产生质疑，进而影响其在职业道路上的发展。特别是在某些行业或领域，职业声誉对于个人职业发展至关重要。
三、对劳动权益保障的影响
- 经济补偿与失业金领取：
- 擅自离职情况下，劳动者一般无法获得经济补偿，因为不符合《劳动合同法》规定的获得补偿条件（如用人单位存在过错）。
- 主动离职（擅自离职）不符合领取失业保险金的条件，因为领取失业保险金需要满足非因本人意愿中断就业等条件。
四、法律责任与实际操作建议
- 法律责任：擅自离职行为可能违反《劳动合同法》等法律法规关于解除劳动合同的程序和义务规定，员工需承担相应的法律责任。根据《劳动合同法》第九十条，劳动者违反本法规定解除劳动合同，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
- 实际操作建议：为避免不必要的麻烦和损失，员工应在离职前与公司进行充分沟通，按照法定程序办理离职手续，确保自己的权益得到妥善保护。这包括但不限于工资结算、社保和公积金转移、离职证明获取等。同时，员工也应了解并遵守公司的规章制度，避免因擅自离职而承担不必要的法律责任。
综上所述，擅自离职行为不仅对当前劳动关系、再就业、劳动权益保障等方面产生负面影响，还可能对个人职业发展造成长远的不利影响。因此，我强烈建议员工在离职前务必与用人单位充分沟通，并按照法律规定和合同约定履行离职手续。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。