结论：事业编制人员长期病假工资没有扣，是否可以补扣，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 依据单位内部规章制度：

   • 如果单位内部有明确的规章制度规定，长期病假期间应扣减一定比例的工资，且该规章制度不违反相关法律法规的强制性规定，那么在发现未扣减工资后，单位理论上是有权进行补扣的。但补扣前应确保已充分告知员工，并给予其合理的解释和申诉机会。
   • 建议：单位在制定规章制度时，应明确病假工资的扣减标准和程序，并在员工入职时或规章制度变更时，通过培训、签收等方式确保员工知晓并同意。

2. 依据劳动合同约定：

   • 如果劳动合同中有关于病假工资扣减的明确约定，且该约定合法有效，那么单位在发现未按照约定扣减工资后，也有权进行补扣。但同样需要确保补扣过程合法合规，不侵犯员工的合法权益。
   • 建议：在签订劳动合同时，双方应就病假工资等福利待遇进行明确约定，以避免后续产生纠纷。

3. 依据法律法规规定：

   • 根据相关法律法规，事业编制人员病假期间的工资待遇应受到一定保护，不得随意降低。但具体是否扣减以及扣减比例，需结合单位性质、工作年限等因素综合考虑。
   • 短期病假：一般不超过2个月的短期病假，工资待遇通常不受影响，全额发放。
   • 长期病假：对于长期病假，如超过2个月，工资可能会按照一定比例扣减。具体比例根据工作年限和地区细则确定。例如，某些地区规定，病假超过2个月但不满6个月的，从第3个月起，工作年限不满10年的发给本人工资的90%，工作年限满10年的工资照发；病假超过6个月的，从第7个月起，工资扣减比例可能更高。
   • 最低工资标准：即使单位有扣减病假工资的规定，也需确保扣减后的工资不低于当地最低工资标准。这是法律法规的强制性要求，单位必须遵守。
   • 建议：单位在扣减病假工资时，应严格遵守相关法律法规的规定，确保扣减后的工资不低于最低工资标准，并保留好相关证据，以备后续可能的争议。

4. 特殊情况考虑：

   • 如果事业编制人员属于特殊岗位或特殊人才，可能享受更人性化的病假工资政策。此时，单位在扣减工资前应充分考虑这些特殊情况，避免侵犯员工的合法权益。
   • 建议：对于特殊岗位或特殊人才，单位可以制定更加灵活和人性化的病假工资政策，以体现对员工的关怀和尊重。

综合建议：

• 对于事业编制人员而言，如果发现长期病假工资未扣减，首先应查看单位内部规章制度和劳动合同中的相关约定，了解自己的权益和义务。
• 如果单位确实存在未扣减工资的情况，且该情况不符合规章制度或劳动合同的约定，员工可以与单位进行沟通协商，要求单位按照约定进行补扣或调整。
• 如果沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 对于单位而言，在处理病假工资问题时，应严格遵守相关法律法规的规定和单位内部规章制度的要求，确保扣减过程合法合规、公平公正。同时，也应加强与员工的沟通协商，避免产生不必要的纠纷和矛盾。