劳动合同的签约主体需根据实际用工管理关系确定，通常以实际用工单位（三级公司）为签约方，但需结合国企内部管理架构和授权情况综合判断。具体分析如下：

1. 以实际用工单位（三级公司）签约为原则

根据《劳动合同法》第10条，劳动合同应由用人单位与劳动者直接签订。若三级公司具备独立法人资格（即拥有营业执照、可独立承担民事责任），且实际承担员工的日常管理、工资发放、社保缴纳等用工职责，则劳动合同应由三级公司与员工签订。
法律依据：

• 《劳动合同法》第2条：中华人民共和国境内的企业、个体经济组织、民办非企业单位等组织（以下称用人单位）与劳动者建立劳动关系，订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，适用本法。
  
• 实务中，法院通常以“实际用工管理”作为判断劳动关系主体的核心标准（参考《关于确立劳动关系有关事项的通知》第1条）。

2. 以二级公司签约为例外情形

若三级公司不具有独立法人资格（如仅为二级公司的分公司或内设部门），或二级公司通过内部授权明确由其统一签订劳动合同（例如集团化管理的国企中，二级公司被授权代表下属三级公司签约），则劳动合同可能由二级公司签订，但需满足以下条件：

• 三级公司无独立用工权（如无营业执照）；
  
• 二级公司出具书面授权文件；
  
• 劳动合同中明确约定员工实际工作地为三级公司，且二级公司承担用工主体责任（如工资、社保由二级公司直接支付）。
  风险提示：若未明确约定责任主体，可能引发劳动争议时二级公司与三级公司互相推诿，员工权益受损。

3. 实务建议

• 核查三级公司资质：要求三级公司提供营业执照，确认其是否为独立法人；
  
• 明确合同主体：若由二级公司签约，需在合同中注明“实际用工单位为三级公司”，并约定工资、社保等由哪方支付；
  
• 保留证据：保存工资条、考勤记录、工作证等材料，证明实际用工关系，避免纠纷时举证困难。

总结：优先以三级公司签约，若三级公司无独立法人资格或存在二级公司授权，则可能由二级公司签约。具体需结合国企内部管理文件和实际用工情况判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询国企劳动用工相关问题。