在食品监督抽样过程中，若当事人不在场，执法部门仍可依法进行抽样，但需遵循法定程序以确保抽样的合法性和有效性。 具体处理方式如下：

1. 执法部门可依法独立进行抽样
   根据《食品安全法》及相关法规，食品监督抽样是行政机关的法定职权，无需当事人签字或在场即可实施。执法人员需两名以上持证人员参与，并出示执法证件、说明来意。若当事人拒不到场，可邀请见证人（如市场管理人员、社区工作人员等）到场，并在抽样文书上注明情况，由见证人签字确认。

2. 抽样过程需全程留痕
   执法人员应通过拍照、录像等方式记录抽样过程，包括样品封存、签字确认等环节。若当事人后续对抽样程序提出异议，这些证据可作为程序合法性的重要依据。例如，若抽样时未邀请见证人或未留存影像资料，可能导致抽样结果被认定为无效。

3. 抽样后需及时送达检验报告
   抽样完成后，执法部门需在规定时间内将样品送检，并在检验报告出具后依法送达当事人。即使当事人未在场，也应通过留置送达、邮寄送达或公告送达等方式确保其知情权。若当事人对检验结果有异议，可在规定期限内申请复检。

4. 当事人权利保障与救济途径

   • 复检权：当事人对检验结论有异议的，可自收到检验报告之日起7个工作日内向实施抽样检验的部门或其上级部门提出复检申请。复检机构需与初检机构独立，且复检结论为最终结论。
     
   • 行政复议或诉讼：若当事人认为抽样程序违法或处罚不当，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销或变更行政行为。

建议：若您作为当事人遇到此类情况，首先需确认执法部门是否履行了法定程序（如出示证件、邀请见证人、留存证据等）。若对程序或结果有异议，应及时通过复检、行政复议或诉讼等途径维护权益。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。