当劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍时，其经济补偿的计算和支付确实需要遵循特定的法律规定。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律依据

主要依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条以及《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的相关规定。这些法律条款明确了经济补偿的计算标准，并特别指出了月工资高于当地职工月平均工资三倍的特殊情形。

二、补偿标准与计算方式

1. 月工资定义：

   • 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
   • 如果劳动者工作不满十二个月，则按照实际工作的月数计算平均工资。

2. 三倍月平均工资上限：

   • 当劳动者的月工资高于当地职工月平均工资的三倍时，经济补偿的标准将按照当地职工月平均工资的三倍数额来计算。

3. 最高补偿年限：

   • 对于月工资高于当地职工月平均工资三倍的劳动者，支付经济补偿的年限最高不超过十二年。这意味着，即使劳动者的工作年限超过十二年，其经济补偿也只会按照十二年的标准来计算。

4. 计算公式：

   • 经济补偿金 = 工作年限（最高不超过12年） × 当地上年度职工月平均工资 × 3

三、示例说明

假设某地区上年度职工月平均工资为5000元，某劳动者在该地区工作了15年，且其月工资高于15000元（即当地职工月平均工资的三倍）。根据法律规定，该劳动者的经济补偿金应按照以下方式计算：

• 经济补偿金 = 12年（最高年限） × 5000元/月（当地职工月平均工资） × 3 = 180000元

四、注意事项

1. “三倍封顶”的适用范围：

   • 这一规定仅适用于经济补偿金，不涉及违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金通常是经济补偿标准的两倍。

2. 地区差异：

   • 各地可能出台细则调整计算方式，例如有些地区可能规定“三倍封顶”基数不含加班费等非常规收入。因此，在具体计算时，需要结合地方政策执行。

3. 证据留存：

   • 用人单位需要提供完整的工资记录来证明劳动者的月工资是否超限。如果无法提供充分证据，可能会按照劳动者的实际工资来计算经济补偿。

五、总结

对于月工资高于当地职工月平均工资三倍的劳动者，其经济补偿金将按照“当地三倍月均工资 × 工作年限（≤12年）”的公式来计算。这一规定旨在确保经济补偿的公平性和合理性，避免过度倾斜高收入群体。在具体操作时，需要结合地方政策和实际情况进行计算。