工伤不在指定医院治疗，可能会产生以下影响：
影响工伤认定：
- 根据相关规定，工伤职工应当到签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。如果未在指定医院治疗，且没有紧急情况等合理理由，可能会影响工伤认定的结果。因为工伤认定机构在审核时，会考虑就医的医疗机构是否符合规定，以及就医过程是否合理。
影响工伤赔偿：
- 工伤赔偿通常与工伤认定结果紧密相关。如果因未在指定医院治疗而导致工伤认定不成立或认定结果受到影响，那么工伤赔偿的金额和范围也可能会相应减少或受到限制。例如，某些治疗费用可能因不符合规定而不被纳入赔偿范围。
可能面临医疗费用报销难题：
- 工伤保险基金通常只报销在指定医疗机构发生的符合规定的医疗费用。如果工伤职工未在指定医院治疗，那么其医疗费用可能无法得到工伤保险基金的报销，需要自行承担或通过其他途径解决。
针对上述影响，我给出以下建议：
尽量选择指定医院治疗：
- 为了确保工伤认定和赔偿的顺利进行，工伤职工应尽量选择签订服务协议的医疗机构进行治疗。这样不仅可以确保医疗费用的报销，还可以避免因就医问题而引发的纠纷。
紧急情况下可先就近急救：
- 如果工伤职工在紧急情况下无法及时到达指定医院，可以先到就近的医疗机构进行急救。但应在情况稳定后及时转至指定医院继续治疗，并保留好相关医疗记录和费用单据，以便后续进行工伤认定和赔偿申请。
及时与用人单位和工伤保险机构沟通：
- 如果因特殊原因确实无法在指定医院治疗，工伤职工应及时与用人单位和工伤保险机构沟通，说明情况并提供相关证明材料。这样可以在一定程度上减少因未在指定医院治疗而带来的不利影响。
若已经发生未在指定医院治疗的情况，应如何处理：
收集并保留相关证据：
- 工伤职工应收集并保留好所有与工伤治疗相关的医疗记录、费用单据等证据材料。这些材料在后续进行工伤认定和赔偿申请时将起到重要作用。
尽快申请工伤认定：
- 工伤职工应在规定时间内尽快申请工伤认定，并如实说明就医情况。如果因未在指定医院治疗而面临认定难题，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
总之，工伤不在指定医院治疗可能会带来一系列不利影响。因此，工伤职工应尽量选择指定医院进行治疗，并在紧急情况下及时与用人单位和工伤保险机构沟通。若已经发生未在指定医院治疗的情况，应尽快收集并保留相关证据，并尽快申请工伤认定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。