在运输合同纠纷中，起诉对象的选择需根据具体情况来确定，可能是司机，也可能是运输公司，或者两者同时作为被告。以下从不同角度为你详细分析：
一、根据合同相对性原则确定起诉对象
若运输合同是与运输公司签订：
- 通常情况下，合同具有相对性，即合同的权利义务主要约束合同双方。因此，如果运输合同是你与运输公司签订的，那么当发生纠纷时，你应当起诉运输公司。
- 例如，你通过某物流公司运输货物，并签订了运输合同。若货物在运输过程中受损，你应当依据合同起诉该物流公司，要求其承担赔偿责任。
若运输合同是与司机个人签订：
- 如果运输合同是你直接与司机个人签订的，那么发生纠纷时，你应当起诉该司机。
- 例如，你通过某个体司机运输货物，并签订了运输合同。若司机未按约定时间送达货物，你应当依据合同起诉该司机，要求其承担违约责任。
二、考虑实际运输过程中的责任归属
司机是运输公司员工的情况：
- 如果司机是运输公司的员工，且在执行工作任务过程中造成纠纷，根据《民法典》的相关规定，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。
- 因此，在这种情况下，即使合同是你与司机签订的，但实际责任应由运输公司承担。你可以选择起诉运输公司，要求其承担赔偿责任。
司机挂靠运输公司的情况：
- 有些司机可能挂靠在运输公司名下从事运输活动。在这种情况下，如果发生纠纷，你可能需要同时起诉司机和运输公司。
- 因为司机是实际运输人，对运输过程中的问题负有直接责任；而运输公司作为挂靠单位，可能因管理不善或未尽到审查义务而承担连带责任。
三、起诉流程与注意事项
确定管辖法院：
- 根据《民事诉讼法》的规定，运输合同纠纷可由运输始发地、目的地或被告住所地人民法院管辖。
- 你应根据实际情况选择合适的管辖法院，以便更高效地解决纠纷。
收集证据：
- 无论起诉司机还是运输公司，都需要收集充分的证据来支持你的诉讼请求。
- 证据可以包括运输合同、运输单据、货物交付凭证、沟通记录、损失证明等。
起草并提交起诉状：
- 起诉状应明确原告、被告的基本信息、诉讼请求、事实和理由等。
- 你需要准备足够的起诉状副本及相关证据材料复印件，并前往选定法院立案窗口提交。
参与庭审与等待判决：
- 在庭审过程中，你需要积极举证、质证，并阐述自己的观点。
- 庭审结束后，耐心等待法院根据双方证据和辩论情况作出的判决。
总结与建议：
- 在运输合同纠纷中，起诉对象的选择需根据合同相对性原则、实际运输过程中的责任归属以及具体情况来确定。
- 如果不确定起诉对象或纠纷较为复杂，建议你详细梳理合同内容、运输过程及相关证据，以便更准确地确定起诉对象和制定诉讼策略。
- 在整个起诉过程中，务必保持冷静、理性，尊重法律程序，并积极配合法院的工作。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。