在确定运输合同纠纷的起诉地时，我们主要依据的是《中华人民共和国民事诉讼法》以及相关的特别程序法规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、基本原则
对于运输合同纠纷，起诉地的确定主要遵循“运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖”的原则。这是《民事诉讼法》第二十七条明确规定的，它适用于铁路、公路、水上、航空运输以及联合运输合同纠纷。
二、具体情形分析
单一运输工具：
- 水运：如果运输是通过水上方式（如船舶）完成的，那么纠纷应由海事法院管辖。
- 铁路运输：若运输是通过铁路完成的，则纠纷应由铁路运输法院管辖。
- 公路或航空运输：对于公路或航空运输，纠纷则由运输始发地、目的地或者被告住所地的人民法院管辖。
联合运输：
- 当运输涉及多种运输工具（如先公路后水运）时，管辖法院的确定会更为复杂。
- 如果联合运输中涉及海事部分，如海上运输与公路或铁路运输的联合，那么与海事有关的部分应由海事法院管辖。
- 如果联合运输中涉及铁路运输部分，则与铁路运输有关的部分应由铁路运输法院管辖。
- 对于同时存在水运和铁路运输的联合运输，法律并未作出具体规定，此时可由当事人协商选择管辖法院。
特殊规定：
- 根据《海事诉讼特别程序法》第六条，因海上运输合同纠纷提起的诉讼，除依照《民事诉讼法》的有关规定外，还可以由转运港所在地海事法院管辖。
- 对于铁路货物运输合同纠纷，根据《最高院关于铁路运输法院案件管辖范围的若干规定》，应由铁路运输法院管辖。
三、实际操作建议
- 查看合同：首先，应仔细查看运输合同中是否有关于管辖法院的特别约定。如果合同中有明确约定，且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么应按照合同约定来确定管辖法院。
- 收集证据：在准备起诉时，应收集与运输合同相关的所有证据，包括合同文本、运输单据、付款凭证等，以证明运输始发地、目的地或被告住所地的具体位置。
- 咨询专业律师：如果对于管辖法院的确定存在疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
四、注意事项
- 在选择起诉地时，应确保所选法院具有管辖权，以避免因管辖问题而导致的诉讼延误或驳回。
- 如果被告住所地与运输始发地或目的地不在同一地区，原告可以根据自身便利和诉讼成本等因素综合考虑选择起诉地。
综上所述，运输合同纠纷的起诉地确定主要依据运输工具类型、合同约定以及相关法律规定。在实际操作中，应仔细查看合同、收集证据并咨询专业律师以确保选择正确的起诉地。