合同无效的认定主要由人民法院或仲裁机构进行。以下是对这一结论的详细解释：
一、认定主体
人民法院：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，人民法院是国家的审判机关，具有对民事案件进行审理和裁判的法定职权。在合同纠纷案件中，法院负责审查合同是否存在无效情形，并作出最终判决。
- 审查内容：法院会仔细审查合同主体是否具备相应的民事行为能力、意思表示是否真实、是否违反法律强制性规定或违背公序良俗等。
- 具体流程：当一方当事人向法院起诉，请求确认合同无效时，法院会立案受理，并在审理过程中要求双方当事人提供证据支持自己的主张。法院会对证据进行审查核实，并依据法律规定作出判决。
仲裁机构：
- 法律依据：如果合同中约定了有效的仲裁条款，当事人可以将合同效力争议提交给仲裁机构进行裁决。仲裁机构根据仲裁协议对合同纠纷进行审理，并作出关于合同效力的裁决。
- 具体流程：当事人依据仲裁协议向仲裁机构提出仲裁申请，仲裁机构受理后会组成仲裁庭进行审理。双方当事人在仲裁庭中进行举证、质证和辩论，仲裁庭根据法律规定和查明的事实作出裁决。此裁决具有终局性，对双方当事人均有约束力。
二、认定情形
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，以下情形可导致合同或合同条款无效：
- 无民事行为能力人实施的民事法律行为无效；
- 行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效；
- 违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效（但该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外）；
- 违背公序良俗的民事法律行为无效；
- 行为人与相对人恶意串通，损害他人合法权益的民事法律行为无效。
三、法律后果
一旦合同被认定为无效，该合同自始没有法律约束力。这意味着合同从订立时起就不具备法律效力，不能产生当事人所预期的法律效果。因此，合同各方应谨慎签订合同，并确保其内容符合法律法规的要求。合同被确认无效后，行为人因该合同取得的财产应当予以返还；若不能返还或没必要返还，则应折价补偿。同时，若有过错的一方因合同无效损害了对方利益，还应承担相应的赔偿责任。
四、特殊情形
虽然一般情况下行政机关不能直接认定合同无效，但在某些特定情形下，如对违反法规强制性规定的合同，行政机关可以在其职权范围内认定该合同无效。然而，这种情况相对特殊，并非行政机关的一般权力。且行政机关的认定并不具有终局性，当事人仍可通过诉讼或仲裁等法定途径寻求救济。
总结与建议：
合同无效的认定是一个严肃的法律问题，需要由具备法定职权的机构来进行。无论是人民法院还是仲裁机构，在认定合同无效时都会严格遵循法律规定和程序，确保公正、公平地处理合同纠纷。因此，当您面临合同无效问题时，建议直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。