结论：揽包工程中甲方扣质保金是否合法，需根据具体情况判断，主要看合同约定以及是否符合相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果双方在合同中明确约定了质保金的扣留比例、期限以及返还条件等，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么甲方按照合同约定扣留质保金是合法的。
   • 例如，合同中约定工程竣工验收合格后，甲方扣留工程总价款的5%作为质保金，在质保期（如2年）满且无质量问题后无息返还。这种情况下，甲方扣留质保金就是合法的。

2. 法律法规角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，质保金通常作为工程质量的一种保证，其扣留和返还应当遵循公平、合理、合法的原则。
   • 如果合同中没有约定质保金，或者约定的质保金比例过高、期限过长，或者返还条件过于苛刻，可能违反法律法规的强制性规定，此时甲方扣留质保金可能不合法。
   • 例如，如果合同中约定的质保金比例超过了工程总价款的合理范围（如过高比例），或者质保期远远超出了行业惯例或法律法规规定的合理期限，那么这样的约定可能被视为无效，甲方扣留质保金也就不合法。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，甲方扣留质保金时应当确保有明确的合同依据，并且扣留的比例、期限等应当合理、合法。
   • 如果甲方无正当理由扣留质保金，或者扣留的金额、期限等超出合同约定或法律法规规定，乙方有权要求甲方返还，并可能通过法律途径维护自己的合法权益。

建议：

• 对于乙方而言，在签订合同时应当仔细审查合同中关于质保金的条款，确保自己的权益得到保障。如果合同中存在不合理的质保金条款，应当及时与甲方协商修改。
• 对于甲方而言，扣留质保金时应当遵循合同约定和法律法规的规定，确保扣留的合法性和合理性。同时，在质保期满后应当及时返还质保金，避免引发不必要的法律纠纷。

可能后果：

• 如果甲方合法扣留质保金，且按照合同约定和法律法规的规定进行返还，那么双方通常不会因此产生法律纠纷。
• 如果甲方非法扣留质保金，或者扣留的金额、期限等超出合同约定或法律法规规定，乙方有权要求甲方返还，并可能通过诉讼等方式维护自己的合法权益。此时，甲方可能面临法律责任和声誉损失等后果。

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