体制内请长病假是否会影响年终绩效，主要取决于单位的具体规章制度、劳动合同约定以及病假的时长和原因。以下是对此问题的详细分析：

一、单位规章制度与劳动合同约定

1. 查看单位规章制度：

   • 体制内单位通常会制定明确的绩效考核制度和年终奖发放规则。这些制度会规定员工在何种情况下可能无法获得或全额获得年终奖。
   • 如果规章制度中明确规定，因个人原因（如频繁请假）导致工作绩效不达标，将影响年终奖的发放，那么请长病假可能会间接影响年终奖。

2. 审查劳动合同：

   • 劳动合同是双方约定的法律文件，其中可能包含关于年终奖的具体条款。
   • 如果劳动合同中明确规定了年终奖的发放条件与出勤率、工作绩效等挂钩，那么请长病假可能会影响年终奖的发放。

二、病假时长与原因

1. 短期病假：

   • 对于短期的病假，如几天或一周以内，通常不会对年终绩效产生显著影响。因为这类病假往往不会严重影响员工的工作进度和整体绩效。

2. 长期病假：

   • 如果员工因病需要长期休假，且休假时间跨越了年终绩效的考核周期，那么可能会对年终绩效产生影响。
   • 长期病假可能导致员工无法完成年度工作任务或达到绩效考核标准，从而影响年终绩效的评定。

3. 病假原因：

   • 如果病假是由于工伤或职业病引起的，根据相关法律法规，员工在医疗期内应享受相应的工资待遇，且不应因此影响年终绩效的发放。
   • 但如果病假是非因工负伤或患病，且影响了工作绩效，则可能影响年终绩效。

三、实际案例与分析

• 案例一：某体制内单位员工小王因突发疾病请了半个月的病假。由于他的病情较轻，且及时安排了工作交接，未对团队工作造成太大影响。年底时，他仍然获得了全额的年终绩效。这说明，在不影响工作绩效的情况下，短期病假通常不会影响年终绩效。
• 案例二：另一体制内单位员工小赵因长期患病请了数月的病假。由于他长时间无法参与工作，导致所在项目的进度受阻，团队绩效受到影响。年底时，他的年终绩效被相应扣减。这表明，长期病假且影响工作绩效的情况下，年终绩效可能会受到影响。

四、建议与维权途径

1. 了解规定：员工在请长病假前应了解单位关于年终绩效发放的相关规定，以避免不必要的纠纷。
2. 沟通协商：对单位规定有疑问或不满时，员工应与单位进行沟通协商，要求单位说明扣发依据。
3. 法律援助：若协商不成，员工可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

总结来说，体制内请长病假是否会影响年终绩效，需综合考虑单位规章制度、劳动合同约定、病假时长和原因等多方面因素。员工应了解自己的权益和单位的规定，必要时采取合适的措施来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。