仓库改建公寓的合法性需根据具体情况判断，若改造行为完全遵循相关法律法规，获得必要审批，并满足安全标准，则为合法；反之，若未经批准或违反相关规定，则为违法。以下是对此问题的详细分析：
一、合法情况分析
规划与审批：
- 改造前必须向相关部门（如规划部门、建设部门）提出申请，并获得批准。这包括提交详细的改造方案，说明改造的目的、范围、方式等，以及确保改造后的公寓符合城市总体规划和详细规划。
- 改造需确保不会对周边环境、公共设施等造成不利影响。例如，改造后的公寓应满足日照、通风、采光等基本居住条件，且不得影响周边建筑的消防安全。
安全标准：
- 结构安全：仓库结构需经专业机构检测加固，以满足居住荷载要求。这包括评估仓库的承重结构、抗震性能等，确保改造后的公寓结构安全可靠。
- 消防安全：按住宅消防标准改造，设置消防设施，如消防栓、灭火器、烟雾报警器等，并确保疏散通道畅通无阻。
- 卫生标准：满足饮用水、排水等居住卫生要求。改造后的公寓应配备完善的给排水系统，确保居民用水安全。
法律依据：
- 遵守《中华人民共和国民法典》、《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国建筑法》等相关规定，确保改造不违反合同约定和法律规定。例如，改造不得侵犯他人的土地使用权、相邻权等合法权益。
二、违法情况分析
违反规划用途：
- 擅自改变仓库的土地使用性质和规划用途，违反城乡规划法律法规。例如，将工业用地上的仓库私自改成住房，破坏了园区的整体规划，可能面临责令恢复原状、罚款等行政处罚。
安全隐患：
- 结构隐患：未合理评估加固结构，可能导致房屋坍塌。仓库的承重结构、抗震性能等可能无法满足居住要求，擅自改造可能引发安全事故。
- 消防隐患：仓库未达住宅消防要求，一旦发生火灾，人员疏散和消防救援困难。例如，仓库可能缺乏必要的消防设施、疏散通道不畅等。
未经许可施工：
- 未办理施工许可证擅自施工，违反《建筑法》等相关规定。这可能导致施工过程中的安全问题无法得到有效监管，增加事故风险。
法律责任：
- 擅自改造可能面临责令恢复原状、罚款等行政处罚。若因违反消防安全规定导致安全事故，相关责任人还需承担刑事责任。
三、实际操作建议
- 了解法律法规：在改造前，应详细了解相关法律法规和审批流程，确保改造计划合法合规。
- 向相关部门申请：提交详细的改造方案和相关材料，积极与规划部门、建设部门等沟通，以获得必要的许可和批准。
- 严格遵守规定：在改造过程中，应严格遵守建筑、消防等法律法规，确保改造后的公寓安全可靠。
- 注重安全与质量：优先考虑居民的生命财产安全，确保改造工程质量和消防安全标准。例如，选择有资质的施工单位进行改造，使用符合标准的建筑材料等。
综上所述，仓库改建公寓的合法性需综合考虑多方面因素。在未获得相关法律许可前，切勿擅自进行改造。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。