结论：离职时年假休超了，工资通常不会被扣除，但具体还需根据实际情况来判断。下面我将从不同角度为你详细分析：
一、年假的法定性质与工资待遇
根据《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，职工连续工作1年以上，即享受带薪年休假。年假期间，职工享受与正常工作期间相同的工资收入，这是法律赋予的权益，不因离职而改变。因此，如果劳动者在离职前已经按照规定休完了年假，用人单位无权因离职而扣回已享受的年假工资。
二、年假休超的特殊情况
超出应休年假天数：
- 如果劳动者的年休假天数超出了按照当年度已工作时间折算应休的年休假天数，且用人单位与劳动者之间有合法有效的书面约定或规章制度明确规定了对多休年假的处理方式（如按日工资收入冲抵多休天数），则在离职时，用人单位可以依据这些规定进行相应处理。但扣除方式必须合理且符合法律法规，不能随意克扣。
- 举例：假设劳动者小张在某公司工作满一年后应休年假5天，但实际休了7天。如果公司规章制度中有明确规定，超出部分需按日工资收入冲抵，且该规定合法有效，那么公司在离职时可以按照小张日工资收入的标准，合理扣除多休的2天年假对应的工资。
无合法约定或规定：
- 如果用人单位没有与劳动者之间有合法有效的书面约定或规章制度明确规定了对多休年假的处理方式，那么用人单位在离职时无权扣除劳动者多休的年假工资。
三、用人单位的义务与劳动者的维权途径
用人单位的义务：
- 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资，包括年假工资。这是用人单位的法定义务，必须履行。
劳动者的维权途径：
- 如果用人单位无故克扣工资，包括年假工资，劳动者有权通过多种途径维护自己的合法权益。首先，可以尝试与用人单位协商沟通，要求其纠正错误做法并足额支付工资；其次，如果协商不成，可以向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理；最后，必要时还可以申请劳动仲裁，通过法律程序来维护自己的合法权益。
四、离职前的注意事项
- 劳动者在离职前，应确保已完成所有工作交接，并遵守公司政策和劳动合同中的条款。同时，也可以提前了解自己的年假情况，包括已休天数和应休天数，以避免因个人原因导致的纠纷。
总结：离职时年假休超了，工资通常不会被扣除，但具体还需根据用人单位与劳动者之间的约定或规章制度以及实际情况来判断。无论如何，用人单位都应在解除或终止劳动合同时结清劳动者工资，而劳动者也有权通过法律途径维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。