当员工有薪年假未出勤时，其工资的计算主要依据《中华人民共和国劳动法》及相关规定来执行。以下是一个详细且清晰的计算方法和说明：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条及《职工带薪年休假条例》第五条，如果用人单位未安排劳动者休年假，那么应支付300%的工资报酬，这其中包括了正常工资。换句话说，除了已经支付的正常工资外，用人单位还需要额外支付200%的工资作为补偿。

二、计算步骤

1. 确定日工资标准：

   • 日工资的计算公式是：月工资收入 ÷ 月计薪天数（固定为21.75天）。
   • 例如，如果员工的月工资是5000元，那么他的日工资大约是5000 ÷ 21.75 ≈ 229.89元/天。

2. 计算未休年假天数：

   • 根据员工的工作年限，年假天数有所不同：累计工作1-10年为5天/年，10-20年为10天/年，20年以上为15天/年。
   • 需要扣除已经休假的天数，同时注意跨年度未休的年假可以结转至下一年，但最长不超过1年。

3. 核算补偿金额：

   • 补偿金额的计算公式是：日工资 × 未休天数 × 200%（因为正常工资已经支付，所以只需要补发2倍的差额）。
   • 例如，如果员工未休5天年假，那么他的补偿金额就是229.89 × 5 × 2 = 2298.9元。

三、特殊情况处理

1. 跨年度未休：

   • 如果单位需要跨年度安排年假，必须征得员工的同意，否则需要按照300%的工资报酬支付。
   • 如果员工离职，单位必须一次性支付未休年假的工资。

2. 主动放弃休假：

   • 如果员工主动放弃休假，需要提交书面申请，单位应留存备查。否则，如果员工事后主张权益，单位仍需支付补偿。

3. 争议解决：

   • 如果双方就年假工资产生争议，可以先尝试协商解决。如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请仲裁，仲裁时效为1年。

四、注意事项

• 证据保留：员工应保存好自己的考勤记录、工资条、与单位的沟通记录等，以避免在发生纠纷时无法提供证据。
• 企业合规：建议单位定期统计员工的年假情况，主动安排休假，并在无法安排时及时支付补偿，以避免法律风险。
• 政策差异：不同地区可能有额外的规定或解释，例如北京就要求跨年未休的年假按日工资的300%支付。因此，在具体操作时，需要结合当地政策执行。

五、示例总结

假设某员工的月工资为8000元，未休年假为5天：

• 日工资：8000 ÷ 21.75 ≈ 367.82元/天
• 应发报酬（含正常工资）：5天 × 367.82元/天 × 300% ≈ 5517.30元
• 若已支付正常工资，则补发：5天 × 367.82元/天 × 200% ≈ 3678.20元

通过以上方法，用人单位和员工都可以清晰地核算出未休年假的薪酬补偿，确保双方的合法权益得到保障。