在第三人起诉确认合同无效的案件中，被告的确定主要依据合同相对性原则以及第三人与合同之间的利害关系，具体分为以下几种情况：
若第三人直接起诉合同双方当事人：
- 在这种情况下，合同双方，即签订合同的甲方和乙方，通常会被列为共同被告。因为第三人主张合同无效，直接涉及的是合同双方的权益，所以双方都需要作为被告参与诉讼，以便在法庭上陈述意见、提供证据，并接受法庭的裁决。
若第三人仅起诉合同一方当事人：
- 如果第三人认为合同无效是由于合同一方当事人的行为或原因导致的，且该行为或原因直接损害了第三人的利益，那么第三人可能会选择仅起诉该方当事人。例如，如果甲方通过欺诈手段与乙方签订合同，且该欺诈行为直接损害了第三人的利益，那么第三人可能会选择仅起诉甲方。
- 然而，在司法实践中，为了全面审查合同的效力，法庭有时可能会根据案件的具体情况，追加合同的另一方当事人作为第三人参与诉讼，以便更全面地了解合同签订和履行的过程，从而作出更公正的裁决。但这种情况并不改变原被告的确定原则，即原被告的确定仍基于第三人的起诉选择。
特殊情况下的被告确定：
- 在某些特殊情况下，如合同涉及多方当事人或存在复杂的法律关系时，被告的确定可能会更加复杂。例如，在涉及多方参与的联营合同、合作合同等案件中，第三人可能需要根据合同的具体内容和各方的法律关系来确定被告。
- 此外，如果合同存在表见代理、无权代理等情形，且第三人因此主张合同无效时，被告的确定也可能涉及代理关系的双方当事人。
法律建议：
- 对于第三人而言，在起诉确认合同无效时，应仔细分析合同的具体内容、签订过程以及各方的法律关系，以确定合适的被告。如果对被告的确定存在疑问或不确定，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
- 对于合同双方而言，如果收到第三人起诉确认合同无效的诉讼材料，应积极应对诉讼，准备相关证据和材料以维护自己的合法权益。同时，也可以考虑咨询专业律师以了解诉讼的风险和可能的法律后果。
可能涉及的法律后果：
- 如果法庭最终裁决合同无效，那么合同双方可能需要承担返还财产、赔偿损失等法律责任。具体责任的大小和范围将根据合同的具体内容、双方的过错程度以及第三人的损失情况等因素来确定。
- 如果第三人起诉的被告选择不当或诉讼策略失误，可能会导致诉讼结果不利或诉讼成本增加等后果。因此，在起诉前应充分评估诉讼风险和可能的结果，并制定合理的诉讼策略。