结论：夫妻关系中，双方都在同一个乡镇但不在一个部门工作，并不直接等同于隶属同一个领导，是否构成任职回避需结合具体职务关系和单位规定来判断。以下从多个角度详细分析：
一、任职回避制度的核心原则
任职回避制度旨在防止因亲属关系（如夫妻关系）影响公务执行的公正性，其核心在于避免直接隶属关系、直接上下级领导关系或监督关系。根据《公务员法》及相关规定，夫妻双方不得在同一机关担任双方直接隶属于同一领导人员的职务，或有直接上下级领导关系的职务。
二、同一乡镇不同部门是否构成隶属关系？
部门独立性：
若夫妻双方所在部门完全独立（如乡镇政府办公室与乡镇财政所），且无直接业务指导或监督关系，则通常不视为隶属同一领导。例如，丈夫在乡镇党政办工作，妻子在乡镇文化站工作，两者无直接管理或监督关系，不构成回避情形。
潜在关联性：
若部门间存在业务交叉或间接管理关系（如乡镇财政所与乡镇经济发展办在资金审批上有协作），需进一步审查单位内部规定。部分单位可能将此类情况纳入回避范围，但法律未明确禁止。
三、需重点审查的职务关系
即使不在同一部门，若夫妻双方存在以下情形，仍可能触发回避：
一方担任领导职务，另一方在其分管领域工作：
例如，丈夫是乡镇副镇长分管财政，妻子在乡镇财政所工作，即使财政所是独立部门，也可能因分管关系需回避。
涉及关键岗位（如财务、人事、纪检）：
若一方从事财务审批，另一方从事审计或纪检工作，即使无直接隶属关系，也可能因岗位敏感性需回避。
四、实际操作建议
查阅单位内部规定：
不同乡镇或单位可能制定更严格的回避细则（如扩大回避范围或明确部门间关联情形），建议优先以单位规定为准。
主动申报与咨询：
若对职务关系存疑，可向单位人事部门主动申报夫妻关系，并咨询是否需调整岗位。单位有义务根据回避制度进行审查并作出合理安排。
法律救济途径：
若单位未依法执行回避制度，可向上级主管部门或纪检监察机关反映情况，维护自身合法权益。
五、法律依据
《公务员法》第七十四条：
公务员之间有夫妻关系、直系血亲关系、三代以内旁系血亲关系以及近姻亲关系的，不得在同一机关双方直接隶属于同一领导人员的职位或者有直接上下级领导关系的职位工作，也不得在其中一方担任领导职务的机关从事组织、人事、纪检、监察、审计和财务工作。
地方实施细则：
部分省份或单位可能出台具体实施办法（如《XX省公务员回避暂行规定》），需结合当地规定进一步判断。
总结：同一乡镇不同部门工作是否构成隶属关系，需结合部门独立性、职务关联性及单位规定综合判断。建议优先咨询单位人事部门，确保符合回避制度要求。如有进一步疑问，可直接向我咨询婚姻家庭领域的法律问题。